החלפה נרדפת – הבדלי גרסאות

כאשר החלפה נרדפת או מוטציה שקטה מתרחשת, השינוי בדרך כלל משוער להיות נטרלי, כלומר הוא לא משפיע על [[כשירות|הכשירות]] של הפרט לשאת את הגן החדש על מנת לשרוד ולהתרבות.

שינויים נרדפים יכולים להיות לא נטרלים מכיוון שמס' קודונים מתורגמים יותר ביעילות (בצורה מהירה יותר ו/או בצורה מדויקת יותר) מאשר האחרים. למשל, כאשר קומץ של שינויים נרדפים התרחשו [[דרוזופילה|בזבוב הפרות]] בגן לאלכוהול דהידרוגנאז, זה גרם לשינוי במס' קודונים כך שהפכו להיות תת-אופטימליים, ייצור של האנזים המקודד הופחת{{הערה|{{צ-מאמר|מחבר=David B. Carlini, Wolfgang Stephan|שם=In vivo introduction of unpreferred synonymous codons into the Drosophila Adh gene results in reduced levels of ADH protein|כתב עת=Genetics|כרך=163|עמ=239–243|שנת הוצאה=2003-01-01|קישור=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/12586711}}}} והזבובים המבוגרים הפגינו [[סבילות]] נמוכה [[אתנול|לאתנול{{הערה|{{צ-מאמר|מחבר=David B. Carlini|שם=Experimental reduction of codon bias in the Drosophila alcohol dehydrogenase gene results in decreased ethanol tolerance of adult flies|כתב עת=Journal of Evolutionary Biology|כרך=17|עמ=779–785|שנת הוצאה=2004-07-01|doi=10.1111/j.1420-9101.2004.00725.x|קישור=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/15271077}}}}]][[|<span class="mw-reflink-text">[7]</span>]][[#cite_note-7|<span class="mw-reflink-text"><nowiki>[7]</nowiki></span>]]. הרבה אורגניזמים, מחיידקים ועד לחיות, עושים שימוש מוטה של קודונים נרדפים מסוימים. שימוש מוטה כזה יכול לנבוע ממס' סיבות, סלקטיביות או ניטרליות. [[שמר האפייה|בשמר האפייה]] שימוש בקודונים נרדפים הראה השפעה על יציבות קיפול ה [[mRNA]] , כאשר קידוד מבנה משני של חלבונים שונים על ידי רנ"א יעדיף קודונים שונים.