עץ פילוגנטי – הבדלי גרסאות
תוכן שנמחק תוכן שנוסף
מ עדכון טקסט בתמונה |
הוספת תמונה של עץ פילוגנטי של נאומורה |
||
שורה 1:
[[קובץ:Phylogenetic_tree.svg|ממוזער|350px|עץ החיים. עץ פילוגנטי מושרש המתאר את היחס בין ממלכות החיים (בקטריה, ארכיאה ואיקריוטה), על סמך ניתוח rRNA.]]
'''עץ [[פילוגנטיקה|פילוגנטי]]''' או '''עץ אבולוציוני''' הוא [[עץ (תורת הגרפים)|גרף עץ]] המייצג את היחסים ההיסטוריים-[[אבולוציה|אבולוציונים]] המשוערים בין מינים ביולוגים שונים על סמך דמיון [[גנום|גנטי]] או [[מורפולוגיה (ביולוגיה)|מורפולוגי]] ביניהם.
שורה 9:
==היסטוריה==
אחד העצים הפילוגנטיים הראשונים והנודעים ביותר שצוירו היה של [[צ'ארלס דרווין]] בספרו [[מוצא המינים]] (1859). הביולוגיה ה[[אבולוציה|אבולוציונית]] עדיין משתמשת בעץ הפילוגנטי לתיאור אבולוציה של יצורים, כיוון שעצים אלה מעבירים בצורה יעילה את [[היווצרות המינים]] שנוצרה תוך כדי [[הסתגלות אבולוציונית|הסתגלות של מינים]] ופיצולים בהמשך השנים.
[[קובץ:Neomuratree.svg|ממוזער|עץ פילוגנטי מושרש, הממחיש כיצד איקריוטים וארכאונים קשורים באופן הדוק יותר זה לזה מאשר [[חיידקים]]. [https://he.wikipedia.org/w/Neomura Neomura] הוא [[קלייד]] המורכב משתי על ממלכות - [[ארכאונים]] ו[[איקריוטים]]. LUCA מייצג את [[האב הקדמון הכולל]].]]
אחד התורמים המשמעותיים לתחום של בניית עצים פילוגנטיים היה [[וילי הניג]] ותרומתיו החשובות ביותר היו השיטה של בדיקת [[הומולוגיה (ביולוגיה)|הומולוגיות]] בין יצורים באמצעות דמיון מורש בין יצורים (כולל [[ריצוף DNA]], בדיקת התנהגות, בדיקות מורפולוגיות וכו') וכן הדגשתו לבדיקת העבר של היצור בעיקר בעזרת מאובנים.
בתחום ה[[ביואינפורמטיקה]] ניתן לבנות עץ פילוגנטי בהינתן מספר רצפים ידועים של מולקולות בעלות תפקוד זהה, כגון רצפי DNA אשר מקודדים לחלבון משותף בין מינים שונים. ה[[אלגוריתם של פיץ']] וה[[אלגוריתם של סנקוף']] הם אלגוריתמים אשר עושים זאת. לשם כך הם משתמשים בשיטת ה[[small parsimony]], אשר מוצאת את האב הקדמון המשותף הסביר ביותר בהינתן עץ נתון, והיא מסתמכת על [[large parsimony]] אשר למעשה מבצעת בדיקת small parsimony על כל העצים האפשריים.בשנת 2001 רות צ׳רני ביחד עם [[קרן ווגטמן]] פיתחו אלגוריתם לחישוב מדויק של העצים הללו.
==ראו גם==
| |||