מלאכי הכהן – הבדלי גרסאות

הוא סידר רבים מחידושיו ככללים המקיפים סוגיות רבות בתלמוד ובדברי הראשונים והאחרונים. הגהותיו לספר [[הליכות עולם (כללים)|הליכות עולם]] נדפסו במהדורות מאוחרות של הספר, בחתימה '''הרמ"ך'''. ספרו "'''[[יד מלאכי]]'''" נדפס לראשונה בחייו בשנת [[ה'תקכ"ז]] ובפעם השנייה ב[[ברלין]] בשנת [[ה'תרי"ז]]. הספר נחשב לאחד מספרי הכללים היסודיים ביותר ומצוטט תדיר בכל ספרות הכללים שלאחריו. הוא זכה למהדורות רבות, האחרונהלאחרונה שבהםגם הודפס ב[[סדר (דפוס)|סדר]] חדש בשנת [[ה'תשס"א]] על ידי מישור ובשנת [[ה'תשע"ו]] על ידי [[מכון ירושלים]] בשלושה כרכים. בשני כרכים הראשונים הודפס עיקר הספר יד מלאכי ובכרך השלישי הודפס כתביו וליקוט דבריו משאר פוסקי זמנו, כולל ביאורו על התורה וכמה משניות, שו"ת ופסקים, "השיר והשבח", ומפתחות. הדירו את הספר עם הערות מקיפים שדנים מעמיקים ומוסיפים על דבריו מכל ספרי הכללים והאחרונים שדנו בדברי המחבר ובאותם נושאים.