בנק מידע החלבונים – הבדלי גרסאות
תוכן שנמחק תוכן שנוסף
Matanyabot (שיחה | תרומות) מ בוט החלפות: לעיתים |
אין תקציר עריכה |
||
שורה 1:
'''בנק מידע החלבונים''' ([[אנגלית]]: '''Protein Data Bank''' או בראשי תיבות '''PDB''') הוא [[מאגר מידע]] ממוחשב אשר מכיל תיאור של המבנה ה[[מרחב תלת-ממדי|תלת ממדי]] של [[מולקולה|מולקולות]] ביולוגיות גדולות, כדוגמת [[חלבון|חלבונים]] ו[[חומצת גרעין|חומצות גרעין]]. המידע, שבדרך כלל מושג ב[[קריסטלוגרפיה באמצעות קרני רנטגן]] או ב[[NMR|ספקטרוסקופיה באמצעות NMR]], ונשלח על ידי [[ביולוג]]ים ו[[ביוכימיה|ביוכימאים]] מרחבי העולם, ניתן לאחזור בחינם מה[[אינטרנט]]. על בנק המידע מפקח ארגון ושמו "Worldwide Protein Data Bank" ("בנק מידע החלבונים ברחבי העולם" בראשי תיבות wwPDB).
בנק המידע הוא מקור חשוב בתחומי ה[[ביולוגיה מבנית|ביולוגיה המבנית]] כדוגמת [[גנומיקה|גנומיקה מבנית]]. מרבית [[כתב עת|כתבי העת]] המדעיים, וכמה מהארגונים המחלקים מענקי מחקר כדוגמת [[המכונים הלאומיים לבריאות]] (NIH) שב[[ארצות הברית]], דורשים כיום מהמדענים לשלוח מידע על מבנים שפוענחו לבנק המידע. בנק המידע הוא המקור הראשי למאות מאגרי מידע נגזרים המסווגים את המידע בצורה שונה. דוגמאות הן שיטת הסיווג המכונה [[SCOP]] (ראשי תיבות של Structural Classification of Proteins – סיווג מבני של חלבונים) ושיטת הסיווג [[CATH]] (ראשי תיבות של שיטת הסיווג Class Architecture Topology Homologous superfamily – מחלקה, ארכיטקטורה, טופולוגיה ומשפחת על הומולוגית) מסווגים מבנים על פי סוג המבנה ומניחים קשרים [[אבולוציה|
| first = H. M.
| last = Berman
| |||