מסילת ירושלים–גנות – הבדלי גרסאות

בנוסף גם [[תחנת הרכבת ירושלים מרכז|תחנת ירושלים מרכז]], שתחילה תוכננה באזור הצטלבות הרחובות יפו והמלך ג'ורג' אך הוסטה לאזור הצטלבות הרחובות יפו והנביאים. מיקום התחנה באזור זה יאפשר למשתמשים בה נגישות למסלול [[הקו האדום של הרכבת הקלה בירושלים|הקו האדום]] הקיים ו[[הקו הכחול של הרכבת הקלה בירושלים|הקו הכחול]] המתוכנן של [[הרכבת הקלה בירושלים#המערך כולו|מערך הרכבת הקלה בירושלים]], ולהמשיך בנסיעה כמעט לכל נקודה מרכזית בעיר{{הערה|{{TheMarker|אורן דורי|תוכנית חדשה: הרכבת מתל אביב תגיע למרכז ירושלים - במקום לכותל|1.3168394|20 באוקטובר 2016}}}}. התחנות המתוכננות וכן המסילה תיבנה בעומק של כ-50 מטרים מתחת לפני הקרקע. עלות הפרויקט מוערכת בכ-2 מיליארד שקל{{הערה|1={{גלובס|עמירם ברקת|תוכנית ראשונית לרכבת לעיר העתיקה בירושלים|1000887447|21 באוקטובר 2013}}}}. המועצה הארצית לתכנון ובנייה אישרה את הפרויקט הזה בפברואר 2020 <ref>{{קישור כללי|כתובת=https://www.haaretz.co.il/news/local/.premium-1.8552988|כותרת=בניגוד לעמדת הגורמים המקצועיים, סמוטריץ' מקדם את אישור הארכת הרכבת לכותל|אתר=www.haaretz.co.il|שפה=he|תאריך_וידוא=2020-02-18}}</ref>.

בהמשך החלו לתכנן תוואי שונה לפיו לאחר תחנת ירושלים מרכז ימשיך הקטע התת-קרקעי של המסילות תחת מרכז העיר לתחנה תת-קרקעית חדשה שתוקם בסמוך ל[[תחנת הרכבת ההיסטורית של ירושלים|תחנת ירושלים ההיסטורית]] המוכרת גם כמתחם החאן, וזאת כדי להימנע מחפירת מנהרות בסמוך לאתרים ארכאולוגים באזור העיר העתיקה. הרכבל המתוכנן בין מתחם החאן אל שער האשפות יהפוך את תחנת הרכבת במתחם החאן לנגישה למטיילים גם בעיר העתיקה. המועצה הארצית לתכנון ובנייה אישרה את התוואי הזה בפברואר 2020.