קרבוניק אנהידראז – הבדלי גרסאות

תוכן שנמחק תוכן שנוסף
מאין תקציר עריכה
תגיות: גרשיים שגויים עריכת קוד מקור 2017
Mia www Mia (שיחה | תרומות)
אין תקציר עריכה
שורה 1:
[[קובץ:Carbonic anhydrase.png|ממוזער|250px|מבנה מרחבי של האנזים קרבוניק אנהידראז]]
'''קרבוניק אנהידראז (CA)''' הוא [[אנזים]] השייך למשפחת המטלואנזימים ([[אנזים|אנזימים]] המכילים [[אטום]] מתכת אחד או יותר החיוני לפעילות האנזים). [[אתר פעיל|האתר הפעיל]] באנזים זה מכיל יון אבץ. אנזים זה [[קטליזה|מזרז באופן קטליטי]] את הפיכת [[דו תחמוצת הפחמן]] ל[[ביקרבונט]] ו[[פרוטון|פרוטונים]]. זוהי ריאקציה המתרחשת לאט למדי בהיעדר [[זרז|קטליזטור]].
 
קרבוניק אנהידראז מגדיל במידה רבה את קצב הריאקציה, כאשר קצב ריאקציה אופייני לכמה צורות שונות של האנזים נע בין 10<sup>4</sup> ל 10<sup>6</sup> תגובות לשנייה.
 
==מבנה ותפקוד==
שורה 12 ⟵ 13:
==ריאקציה==
[[קובץ:Carbonic Anhydrase mechanism.jpg|ממוזער|300x300 פיקסלים|מנגנון הפעולה של קרבוניק אנהידראז ]]
קצב הריאקציה של קרבוניק אנהידראז נחשב מהיר מאוד יחסית להרבה אנזימים אחרים, ולמעשה אנזים זהוהוא נחשב ל''"אנזים מושלם''" כיוון שקצב הריאקציה שלו כל כך מהיר כך שהוא מוגבל רק על ידי קצב ה[[דיפוזיה]] של ה[[סובסטרט]] שלו.
 
ברקמות בהםבהן יש ריכוז גבוה של CO<sub>2</sub> (לדוגמה, בכלי הדם בקרבת שרירים) תזורז הריאקציה:
 
:<math>\rm CO_2 + H_2O \rightarrow H_2CO_3 \rightarrow HCO_3^- + H^+</math>
 
בעוד שהריאקציה ההופכית תזורז כאשר ריכוז CO<sub>2</sub> יהיה נמוך (בריאות).
 
===מנגנון פעולה===
ה[[קבוצה פרוסטטית|קבוצה הפרוסטטית]] (אבץ בדרך כלל) קשורה בשלוש עמדות על ידי טבעות ה[[אימידזול]] של [[חומצת אמינו|חומצת האמינו]] [[היסטידין]]. לעמדה הרביעית נקשרת מולקולת מים. סידור זה, גורם ל[[קוטביות (כימיה)|קיטוב]] (פולריזציה) של מולקולת המים, כל שיכול להיווצר יון [[הידרוקסיד]], שהוא [[נוקלאופיל]] חשוב בתגובה זו. בנוסף, [[היסטידין]] רביעי ממוקם קרוב למקום קישור המים ויכול לקבל [[פרוטון]] ([[קטליזה|קטליזת]] חומצה-בסיס) ולכן לסייע ליצירת ההידרוקסיד באתר הפעיל.
 
ה[[אתר פעיל|אתר הפעיל]] מכיל גם כיס מיוחד עבור [[דו תחמוצת הפחמן]] המביא אותו קרוב לקבוצת ה[[הידרוקסיד]] מה שמאפשר ל[[הידרוקסיד]] לתקוף את [[דו תחמוצת הפחמן]] ליצירת [[ביקרבונט]].
 
==משפחת הקרבוניק אנהידראז==
ישנם לפחות חמישה תתי-משפחות שונות של קרבוניק אנהידראז - α, β, γ, δ, ε.
 
בין המשפחות אלו אין דמיון משמעותי ברצפי [[חומצת אמינו|חומצות האמינו]] שלהם, וברוב המקרים, נחשבים כדוגמה טובה ל[[אבולוציה מתכנסת]].
 
*'''α-CA''' - אנזימי הקרבוניק אנהידראז הנמצאים ביונקים, מתחלקים ל4 תתי קבוצות רחבות שכל אחד מהם מורכב מכמה [[איזופורם (חלבון)|איזופורמים]] שונים: ב[[ציטוזול]], ב[[מיטוכונדריה]], אנזים מופרש ואנזים הקשור ל[[ממברנה ביולוגית|ממברנה]].
*'''β-CA''' - רוב אנזימי הקרבוניק אנהידראז של ה[[פרוקריוטים]] ושל ה[[כלורופלסט]] בצמחים שיכיים למשפחה זו.
*'''γ-CA''' - מחלקת הגמא נמצאה ב[[חיידקים|בקטריה]] המייצרת את גז ה[[מתאן]].
*'''δ-CA''' - מחלקת הדלתא נמצאה ב[[צורניות]] (אך קיומה של מחלקה זו הוטל לאחרונה בספק)<ref>{{צ-מאמר|שם=The Structure of β-Carbonic Anhydrase from the Carboxysomal Shell Reveals a Distinct Subclass with One Active Site for the Price of Two|קישור=http://www.jbc.org/content/281/11/7546|כתב עת=Journal of Biological Chemistry|שנת הוצאה=2006-03-17|עמ=7546–7555|כרך=281|doi=10.1074/jbc.M510464200|מחבר=Michael R. Sawaya, Gordon C. Cannon, Sabine Heinhorst, Shiho Tanaka}}</ref>).
*'''ε-CA''' - מחלקת האפסילון של CA קיימת בעיקר ב[[חיידקים|בקטריה]] וב[[כחוליות]] ימיות מסוימות. אנליזות תלת ממדיות שבוצעו לאחרונה גילו שε-CA נושא דמיון מבני לβ-CA בעיקר ליד מיקום יוני המתכת. לכן, ייתכן ו2 המחלקות הללו קשורות אחת לשנייה באופן אבולוציוני מרוחק למרות שרצפי [[חומצת אמינו|חומצות האמינו]] הבסיסיות שלהם השתנו מאז בצורה רבה.