יונתן זקס – הבדלי גרסאות

הרב זקס הקפיד על שימור הקו ה[[יהדות אורתודוקסית|אורתודוקסי]] של הרבנות הראשית הבריטית, אף שהדבר עלה לו בביקורת ובעימותים. ב-1997 החרים את הלווייתו של הרב ה[[התנועה ליהדות רפורמית|רפורמי]] והידוען [[הוגו גרין]], אך הסכים להשתתף בטקס אזכרה לכבודו. במכתב ל[[אב"ד]] לונדון הרב [[חנוך דב פאדווא]] הצטדק בטענה שבא להוקיר את "אותו האיש" כניצול שואה ולא כאיש דת, וכי צעדי פיוס כאלה נדרשו גם כדי למנוע מהרפורמים מהרסי ומחריבי הדת לתבוע עצמאות מהממסד בראשותו. המכתב הודלף לתקשורת ועורר שערוריה. במקרה נוסף, ב-2003, גיבה בית-כנסת בבורנמות' שמנע עלייה לתורה מ[[לואיס ג'ייקובס]] – שסולק מק"ק כנסת ישראל ב-1961 באשמת כפירה ב[[תורה מן השמים]]. ב-2002 כתב בספרו 'לכבוד השוני' כי "אלוהים דיבר אל האדם בשפות רבות, בנצרות לנוצרים ואסלאם למוסלמים". הדבר עורר ביקורת וחשש בקרב רבני ק"ק כנסת ישראל, ובדיון מיוחד במנצ'סטר הסביר זקס כי לא התכוון אלא לדברי הרמב"ם ב[[משנה תורה]] (הלכות מלכים י"א י"א) כי "וכל הדברים האלו של ישוע הנוצרי, ושל זה הישמעאלי שעמד אחריו אינן אלא ליישר דרך למלך המשיח". המשפט הוסר במהדורה הבאה.{{הערה|[https://www.theguardian.com/commentisfree/2013/aug/25/chief-rabbi-jonathan-sacks-editorial [Lord Sacks: the two sides of the chief rabbi, [[הגרדיאן]], 25 באוגוסט 2013;{{כ}} [http://www.telegraph.co.uk/news/uknews/1408406/Chief-Rabbi-to-amend-heresy.html Chief Rabbi to amend 'heresy'], [[דיילי טלגרף]], 27 בספטמבר 2002.;{{כ}} [http://www.independent.co.uk/news/leaked-letter-widens-schism-in-jewry-1272921.html Leaked letter widens schism in Jewry], [[האינדפנדנט]], 15 במרץ 1997.}}