שעון מולקולרי – הבדלי גרסאות

תוכן שנמחק תוכן שנוסף
ברוקולי (שיחה | תרומות)
ערך חדש ומתורגם
 
ברוקולי (שיחה | תרומות)
מ ←‏כיול: זוטא
שורה 31:
באופן מיוחד, מודלים שלוקחים בחשבון שינויים בקצב לרוחב אילנות יוחסין הוצעו על מנת להשיג הערכות טובות יותר של זמן ההתפלגות (ופרמטרים אחרים שניתן להעריך אותם מקצבי ההחלפה, כגון גודל האוכלוסייה האפקטיבי). מודלים אלה נקראים "שעונים מולקולריים רגועים".
 
מודלים אלו, הנשענים על מדגם של מידע הטרו-כרונומטרי מהרצף, פותחו מ[[פילוגנטיקה|פילוגנזה]] של [[נגיף|נגיפים]] ומחקרים של DNA עתיק, שני אזורים של הביולוגיה האבולוציונית שבהם ניתן לדגום רצפים במהלך קנה מידה אבולוציוני, ובכך לספק מידע מכייל מלבד זה המסופק בדרך כלל על ידי תיעוד המאובנים.
 
הם ידועים כמודלים של "שעון רגוע" כיוון שהם מייצגים עמדת ביניים בין היפותזת השעון המולקולרי "הקשוחה" ומודל השיעורים המרובים של פלסנסטיין והם נעשים אפשריים דרך שימוש בטכניקות שרשרת מרקוב ומונטה קרלו (MCMC) החוקרות טווח נרחב של טופולוגיות עצים ובאופן סימולטני מעריכות פרמטרים של מודל ההחלפה הנרחב.