מבנה שלישוני – הבדלי גרסאות
תוכן שנמחק תוכן שנוסף
שורה 22:
==קביעת מבנים שלישונים בחלבון==
קביעת המבנה המרחבי של מרבית ה[[חלבון|חלבונים]] הידועים כיום נעשתה על ידי 2 שיטות עיקריות. הראשונה הינה [[קריסטלוגרפיה]] בקרני X. שיטה המראה את המבנה התלת מימדי המדוייק של החלבון. דרך שניה נפוצה לניבוי המבנה השלישוני ניקראת [[NMR]]. שיטה המגלה מבנה [[אטום|אטומי]] או מולקולרי ב[[תמיסה]], כל עוד החלבונים בתמיסה ב[[ריכוז (כימיה)|ריכוז]] גבוהה. במידע המתקבל בטכניקה זו אפשר לסיק מהם השינויים החלים בקבוצות שונות בתנאים שונים.כיום קיים מידע יותר מדויק על החלבונים הגלובולרים מאשר על חלבוני ה[[ממברנה ביולוגית|ממברנה]], וזאת מכוון שיש קושי רב בביצוע שיטות ניבוי אלה לקביעת המבנה השלישוני בחלבונים הממברנה, עקב המיקום של שיירים הידרופובים והידרופילים שלהם.
קושי נוסף בניבוי המבנה השלישוני הוא [[פרדוקס לוינתל]], המייצג דילמה :כיצד חלבונים מתקפלים כה מהר. אם ניקח [[חלבון]] לא גדול במיוחד המורכב מכ-300 [[חומצות אמינו]]. ולכל חומצת אמינו ישנן 3 [[דרגות חופש]] חישוב פשוט מראה שישנן כ3<sup>300</sup> תצורות שונות .מספר אפשרויות הקיפול עצום . בהנחה שהמעבר מתצורת חלבון אחת לתצורת חלבון אחרת, לוקח כ-{{SN|10|-13}} בחזקת שניות ,חלבון המנסה להתקפל על ידי חיפוש התצורה הנכונה באופן אקראי של ניסוי וטעיה, יקח עד יותר מ-{{SN|10|100}} שנים להגיע למצב הרצוי - זמן העולה על [[גיל היקום]]. למרות זאת בתוך ה[[תא]] קיפול החלבון לוקח שניות מעטות.
הפיתרון לפרדוקס הוא: בעת קיפול החלבון, החלבון אינו עובר דרך כל הקונפורמציות האפשריות, אלא קיפול החלבון לקונפורמציה מסוימת, בעלת האנרגיה הנמוכה ביותר, מונע את ההיתכנות של רבות מהאפשרויות האחרות,ולכן תחום אפשרויות הקיפול האפשריות מצטמצם מאוד עם התקדמות קיפול החלבון.
==הקשר בין מבנה שלישוני לתפקיד החלבון==
| |||