הרב יוסף עומד בראש בית המדרש "יחוה דעת", המכשיר רבנים המשמשים בישראל ובמדינות אחרות, מיום הקמתו.
מפעלו הספרותי העיקרי, שהחל בשנת תשנ"ט, הוא סדרת ספרי ההלכה הלכה ברורה, שזכתה בפרס לספרות תורנית בירושלים[דרוש מקור].
הרב יוסף התפרסם בתמיכתו באריה דרעי במאבק הפנימי בש"ס, ובמלחמה על לבו של אביו למען השבתו של דרעי לתפקיד יו"ר התנועה.
הרב יוסף מוסר את השיעור שאביו נהג למסור במשך עשרות שנים בבית מדרשו "יחוה דעת" ביום ראשון[1].
בעצרת הזיכרון לאביו במלאת השבעה הכריז הרב שלום כהן על צירופו של הרב דוד יוסף למועצת החכמים של ש"ס[2]. באוקטובר 2020 פרש מתפקיד רב שכונת הר נוף, בעקבות עתירה שהוגשה נגדו בבג"ץ בדרישה להעמידו לדין משמעתי בגין דברים חריפים שהטיח כנגד התנועה הרפורמית, ובקריאות להצביע בבחירות עבור תנועת ש"ס[3][4][5][6].
"הלכה ברורה" - על שולחן ערוך אורח חיים. עד כה יצאו 19 כרכים, המקיפים את חלקים א-ב של המשנה ברורה וחלק מהלכות שבת (סימנים רמ"ב - רפ"ו, וכרך על סימן שיח). בסוף כל כרך נדפס שו"ת אוצרות יוסף, שבו דן בשאלות בנושאים אקטואליים.
"הלכה ברורה - אמירה לעכו"ם", אמירה לעכו"ם בשבת ושותפות עם עכו"ם בשבת, שלשה כרכים.
"תורת המועדים" - הלכות המועדים, ה' כרכים
"ציונים והערות"- על דברי הרמב"ם בשו"ת "פאר הדור". נדפס על ידי מכון ירושלים וקיבל הסכמה מאביו ומהרב אלישיב.
יחד עם אחיו הרב יצחק יוסף (משמאל)"תורת הטהרה" - הלכות טהרת המשפחה, קיצור של פסקי אביו שנכתבו בסדרת הספרים טהרת הבית
"אורחות מרן" - עדויות על הנהגותיו של אביו, לפי סדר השולחן ערוך. עד עתה יצאו שני כרכים על סדר היום (תשע"ו), וכרך שלישי על שבת (תשע"ח, שבת א').
"הגדה של פסח" - שיחות וביאורים, בתוספת דברים אשר שמע מאביו. נערך על ידי הרב יעקב פוזן.
"ימים נוראים" - שיחות וביאורים, בתוספת שיחות ששמע מאביו וכן "אורחות מרן" - הנהגות מאביו בימים הנוראים. נערך על ידי הרב יעקב פוזן.
"כי בא השמש" - ביאור על סוגיית בין השמשות ושיטת רבנו תם, וחיזוק שיטת אביו בעניין (תשע"ז). כולל קונטרס בנושא תוספת שבת.
"טהרת הבית הקצר" - פסקי הרב עובדיה יוסף בהלכות טהרת המשפחה מתוך ספריו "טהרת הבית" ו"משמרת הטהרה" (תשע"ט).
אתר האינטרנט הרשמי של בית מדרש יחווה דעת
במחאה על ניצול הציבור הספרדי בידי מדינת משטרה, סרטון באתר יוטיוב (אורך: 01:35)
דוד בן עובדיה יוסף (1957-), דף שער בספרייה הלאומית
