p53

חלבון מדכא גידולים

p53 הוא חלבון מדכא גידולים המקדם אפופטוזה או מוות תאי בתגובה לנזקי DNA. משמש כמנגנון הגנה לתאים. נקרא גם "שומר הגנום"

TP53
מבנים זמינים
בנק מידע החלבוניםחיפוש אורתולוגים: PDBe RCSB
רשימת מבנים

4QO1, 1A1U, 1AIE, 1C26, 1DT7, 1GZH, 1H26, 1HS5, 1KZY, 1MA3, 1OLG, 1OLH, 1PES, 1PET, 1SAE, 1SAF, 1SAK, 1SAL, 1TSR, 1TUP, 1UOL, 1XQH, 1YC5, 1YCQ, 1YCR, 1YCS, 2AC0, 2ADY, 2AHI, 2ATA, 2B3G, 2BIM, 2BIN, 2BIO, 2BIP, 2BIQ, 2FEJ, 2FOJ, 2FOO, 2GS0, 2H1L, 2H2D, 2H2F, 2H4F, 2H4H, 2H4J, 2H59, 2J0Z, 2J10, 2J11, 2J1W, 2J1X, 2J1Y, 2J1Z, 2J20, 2J21, 2K8F, 2L14, 2LY4, 2MEJ, 2MWO, 2MWP, 2MZD, 2OCJ, 2PCX, 2RUK, 2VUK, 2WGX, 2X0U, 2X0V, 2X0W, 2XWR, 2YBG, 2YDR, 2Z5S, 2Z5T, 3D05, 3D06, 3D07, 3D08, 3D09, 3D0A, 3DAB, 3DAC, 3IGK, 3IGL, 3KMD, 3KZ8, 3LW1, 3OQ5, 3PDH, 3Q01, 3Q05, 3Q06, 3SAK, 3TG5, 3TS8, 3ZME, 4AGL, 4AGM, 4AGN, 4AGO, 4AGP, 4AGQ, 4BUZ, 4BV2, 4HFZ, 4HJE, 4IBQ, 4IBS, 4IBT, 4IBU, 4IBV, 4IBW, 4IBY, 4IBZ, 4IJT, 4KVP, 4LO9, 4LOE, 4LOF, 4MZI, 4MZR, 4X34, 4ZZJ, 5AOL, 5ABA, 5AOK, 2MWY, 5A7B, 5AOJ, 5AOI, 5ECG, 5AB9, 4FZ3, 4RP6, 4XR8, 5AOM, 4RP7, 5HOU, 5HP0, 5HPD, 5LGY, 5G4M, 5G4O, 5G4N, 5BUA

מזהים
שמות נוספיםTP53, BCC7, LFS1, P53, TRP53, tumor protein p53, BMFS5, Genes, p53
מזהים חיצונייםOMIM: 191170 MGI: 98834 HomoloGene: 460 GeneCards: TP53
מיקום הגן (באדם)
כרומוזום 17
כרומוזוםכרומוזום 17[1]
כרומוזום 17
מיקום גנומי עבור TP53
מיקום גנומי עבור TP53
עמדה17p13.1התחלה7,661,779 bp[1]
סוף7,687,538 bp[1]
מיקום הגן (בעכבר)
כרומוזום 11 (בעכבר)
כרומוזוםכרומוזום 11 (בעכבר)[2]
כרומוזום 11 (בעכבר)
מיקום גנומי עבור TP53
מיקום גנומי עבור TP53
עמדה11 B3|11 42.83 cMהתחלה69,471,185 bp[2]
סוף69,482,699 bp[2]
תבנית ביטוי RNA


נתוני התבטאות נוספים
אונטולוגיית גנים (GO)
תפקיד מולקולרי protein N-terminus binding
GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity
protein self-association
core promoter sequence-specific DNA binding
GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
protein phosphatase binding
קשירת ATP
transcription factor binding
קשירת יוני מתכת
protein phosphatase 2A binding
enzyme binding
zinc ion binding
chromatin binding
protease binding
damaged DNA binding
GO:0001948, GO:0016582 קשירת חלבונים
histone acetyltransferase binding
copper ion binding
protein kinase binding
chaperone binding
GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
receptor tyrosine kinase binding
p53 binding
קשירת חלבון דומה
protein heterodimerization activity
UB
RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding
DNA binding
GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding
TFIID-class transcription factor complex binding
mRNA 3'-UTR binding
histone deacetylase binding
disordered domain specific binding
promoter-specific chromatin binding
histone deacetylase regulator activity
protein homodimerization activity
MDM2/MDM4 family protein binding
מיקום בתא ציטופלזמה
מיטוכונדריון
גרעין התא
nuclear body
transcription factor TFIID complex
nuclear matrix
replication fork
גרעינון
רשתית תוך-פלזמית
נוקלאופלזמה
mitochondrial matrix
PML body
ציטוזול
intracellular anatomical structure
transcription regulator complex
GO:0009327 מבנה מקרומולקולרי
site of double-strand break
תהליכים ביולוגיים positive regulation of histone deacetylation
DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in cell cycle arrest
rhythmic process
replicative senescence
negative regulation of telomerase activity
oligodendrocyte apoptotic process
cellular response to DNA damage stimulus
intrinsic apoptotic signaling pathway
positive regulation of neuron apoptotic process
regulation of mitochondrial membrane permeability
positive regulation of reactive oxygen species metabolic process
cellular response to ionizing radiation
positive regulation of thymocyte apoptotic process
negative regulation of helicase activity
מחזור התא
Ras protein signal transduction
שגשוג תאי
cellular response to hypoxia
negative regulation of cell population proliferation
nucleotide-excision repair
cellular response to glucose starvation
GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated
GO:1904576 response to antibiotic
transcription, DNA-templated
ER overload response
GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated
negative regulation of cell growth
intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator
positive regulation of peptidyl-tyrosine phosphorylation
GO:0022415 viral process
response to gamma radiation
negative regulation of fibroblast proliferation
positive regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway
התמיינות תאים
determination of adult lifespan
positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to endoplasmic reticulum stress
cellular response to UV
DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator
בקרה שלילית של תהליך אפופטוזה
protein tetramerization
oxidative stress-induced premature senescence
positive regulation of release of cytochrome c from mitochondria
circadian behavior
GO:0045996 negative regulation of transcription, DNA-templated
GO:0034613 protein localization
intrinsic apoptotic signaling pathway in response to DNA damage by p53 class mediator
positive regulation of execution phase of apoptosis
multicellular organism development
positive regulation of protein insertion into mitochondrial membrane involved in apoptotic signaling pathway
GO:1901313 בקרה חיובית של ביטוי גנים
mitotic G1 DNA damage checkpoint signaling
positive regulation of protein oligomerization
positive regulation of apoptotic process
entrainment of circadian clock by photoperiod
response to X-ray
GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II
base-excision repair
DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator resulting in transcription of p21 class mediator
regulation of cell cycle G2/M phase transition
proteasome-mediated ubiquitin-dependent protein catabolic process
regulation of signal transduction by p53 class mediator
GO:0097285 אפופטוזה
transcription by RNA polymerase II
positive regulation of protein export from nucleus
GO:0010703, GO:0010702 מוות תאי מתוכנת
regulation of apoptotic process
protein deubiquitination
phosphatidylinositol-mediated signaling
GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II
אוטופגיה
mRNA transcription
cytokine-mediated signaling pathway
positive regulation of RNA polymerase II transcription preinitiation complex assembly
RNA polymerase II preinitiation complex assembly
protein homotetramerization
GO:0034622 protein-containing complex assembly
cellular response to gamma radiation
signal transduction by p53 class mediator
cellular response to actinomycin D
positive regulation of pri-miRNA transcription by RNA polymerase II
positive regulation of production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA
in utero embryonic development
somitogenesis
release of cytochrome c from mitochondria
hematopoietic progenitor cell differentiation
T cell proliferation involved in immune response
B cell lineage commitment
T cell lineage commitment
response to ischemia
double-strand break repair
GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
protein import into nucleus
GO:0001306 response to oxidative stress
transforming growth factor beta receptor signaling pathway
גסטרולציה
negative regulation of neuroblast proliferation
central nervous system development
heart development
מקצב יומי
negative regulation of DNA replication
rRNA transcription
response to UV
response to salt stress
embryo development ending in birth or egg hatching
negative regulation of gene expression
positive regulation of cardiac muscle cell apoptotic process
cerebellum development
negative regulation of transforming growth factor beta receptor signaling pathway
T cell differentiation in thymus
regulation of tissue remodeling
multicellular organism growth
positive regulation of mitochondrial membrane permeability
positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to stress
regulation of cell population proliferation
mitochondrial DNA repair
regulation of DNA damage response, signal transduction by p53 class mediator
regulation of neuron apoptotic process
negative regulation of proteolysis
negative regulation of mitotic cell cycle
bone marrow development
embryonic organ development
protein stabilization
GO:0051312, GO:0007083 chromosome organization
neuron apoptotic process
regulation of cell cycle
hematopoietic stem cell differentiation
interferon-gamma-mediated signaling pathway
cardiac septum morphogenesis
positive regulation of transcription from RNA polymerase II promoter in response to hypoxia
positive regulation of programmed necrotic cell death
intrinsic apoptotic signaling pathway in response to endoplasmic reticulum stress
regulation of thymocyte apoptotic process
GO:0060554, GO:0060555 necroptosis
cellular response to UV-C
negative regulation of mitophagy
regulation of mitochondrial membrane permeability involved in apoptotic process
regulation of intrinsic apoptotic signaling pathway by p53 class mediator
negative regulation of production of miRNAs involved in gene silencing by miRNA
negative regulation of glucose catabolic process to lactate via pyruvate
intrinsic apoptotic signaling pathway in response to hypoxia
regulation of fibroblast apoptotic process
negative regulation of reactive oxygen species metabolic process
regulation of cellular senescence
מקורות: Amigo / QuickGO
אורתולוגים
מיניםאדםעכבר
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)
NM_001276761
NM_000546
NM_001126112
NM_001126113
NM_001126114

NM_001126115
NM_001126116
NM_001126117
NM_001126118
NM_001276695
NM_001276696
NM_001276697
NM_001276698
NM_001276699
NM_001276760

NM_001127233
NM_011640

RefSeq (חלבון)
NP_000537
NP_001119584
NP_001119585
NP_001119586
NP_001119587

NP_001119588
NP_001119589
NP_001119590
NP_001263624
NP_001263625
NP_001263626
NP_001263627
NP_001263628
NP_001263689
NP_001263690

NP_001120705
NP_035770

מיקום (UCSC)Chr 17: 7.66 – 7.69 MbChr 11: 69.47 – 69.48 Mb
חיפוש PubMed[3][4]
ויקינתונים
צפייה/עריכה נתוני אדםצפייה/עריכה נתוני עכבר

החלבון הוא גורם שעתוק הפועל על ידי ויסות פעולתם של גנים אחרים הקשורים למחזור התא. לפיכך, כאשר החלבון או הגן המקודד אותו לא בא לידי ביטוי הוא עלול לגרום להתפתחות גידולים.

באופן נורמלי נמצא p53 בציטופלזמה במצב בלתי-פעיל, אז הוא מעוכב על ידי חלבון Mdm2, אך בעקבות עקה שנגרמת מקרינה מייננת או חומר מסרטן מופעל החלבון p53 על ידי החלבון ATM, וכאשר הוא נכנס לגרעין התא הוא גורם לשעתוק הגן המקודד לחלבון p21, המעכב קינאזים הכרחיים לשכפול הדנ"א. ברוב התאים הסרטניים, כלומר במצב לא תקין, מנוטרלת פעילותו של החלבון p53 והדנ"א הפגום משוכפל. אף על פי שפעמים רבות נמצא החלבון בכמות גדולה הוא לרוב מוטנטי או שאינו מופעל בגלל חלבון ATM מוטנטי.

הגן המקודד ל-p53 שוכן על גבי כרומוזום 17 באדם. החלבון מורכב מ-393 חומצות אמינו. התמונה ממחישה את המבנה של החלבון כאשר הוא עובר אינטראקציה עם DNA. כאשר החלבון נמצא באינטראקציה עם DNA יש לו מבנה שונה[דרושה הבהרה], לאו דווקא מוגדר.

החלבון התגלה לראשונה ב-1979 על ידי שש מעבדות שונות באופן עצמאי. אחת מהן הייתה פרופ' ורדה רוטר ממכון ויצמן והגן שוכפל לראשונה באופן מלאכותי על ידי פרופ' משה אורן ממכון ויצמן ב-1983. רק ב-1989 התגלו תכונותיו האנטי-סרטניות. בתחילה הוא היה נחשב בטעות כאונקוגן אך רק יותר מאוחר התברר שהוא גן שמונע התפתחות גידולים (Tumour Suppressor).

מוטציה בP53 תגרום בדרך כלל לסרטן.

קישורים חיצוניים עריכה

הערות שוליים עריכה

  1. ^ 1 2 3 GRCh38: Ensembl גרסה 89: ENSG00000141510 - Ensembl, מאי 2017
  2. ^ 1 2 3 GRCm38: Ensembl גרסה 89: ENSMUSG00000059552 - Ensembl, מאי 2017
  3. ^ "Human PubMed Reference:".
  4. ^ "Mouse PubMed Reference:".
  ערך זה הוא קצרמר בנושא ביולוגיה. אתם מוזמנים לתרום לוויקיפדיה ולהרחיב אותו.