כלי יקר – הבדלי גרסאות

במספר מקומות דן הפירוש בסוגיות של אמונה ויסודות היהדות, ולהגןובהגנה עליהםעליהן מפני המכחישים אותן. לדוג', על מנת "לסתום פי דוברי עתק על תורתנו הקדושה" הביא הפירוש ב[[פרשת בחוקותי]] שבעה הסברים קצרים (אותם כתב בתחילה ה[[אברבנאל]]) מדוע לא מוזכר בתורה השכר הרוחני, ומוזכר רק הגשמי. במקום אחר<ref>ויקרא, י"ט, י"ח</ref> מוסבר מדוע אין הקב"ה נוקם ברשעים המרעים לצדיקים.