שלשה קטליטית – הבדלי גרסאות

תוכן שנמחק תוכן שנוסף
MerlIwBot (שיחה | תרומות)
מ בוט מוסיף: ja:触媒三残基
מ עריכה
שורה 1:
{{לעריכה|נדרשת הגהה על כל הערך ופישוט הנאמר, למשל "כתוצאה מכך סרין מאוקטבת"|נושא=מדעי הטבע}}
'''שלשה קטליטית''' (catalytic triad) הינוהוא מונח ב[[ביוכימיה]] המתייחס לרוב לשלוש [[חומצת אמינו|חומצות אמינו]] הנמצאות ב[[אתר פעיל|אתר הפעיל]] של מספר [[פרוטאז|אנזימי פרוטאזות]] וחיוניתוחיוניות לפעילותן.
 
לדוגמה, שלוש חומצות האמינו [[סרין]], [[חומצה אספרטית|אספרטט]] ו[[היסטידין]] הן השלשה הקטליטית במשפחת ה[[סרין פרוטאז|סרין פרוטאזות]]. שלושתן פועלות יחד במטרה לבקע [[קשר פפטידי|קשרים פפטידיים]] ב[[חלבון|חלבונים]].
 
השלשה הקטליטית של [[ציסטאין פרוטאז|ציסטאין פרוטאזות]] שונה רק בחומצה אמינית אחת מהשלשה של סרין פרוטאזות: החומצה האמינית [[ציסטאין]] מחליפה את סרין, וממלאת תפקיד דומה לה.
 
לדוגמה, שלוש חומצות האמינו [[סרין]], [[חומצה אספרטית|אספרטט]] ו[[היסטידין]] הן השלשה הקטליטית במשפחת ה[[סרין פרוטאז|סרין פרוטאזות]]ות. שלושתן פועלות יחד במטרה לבקעבביקוע [[קשר פפטידי|קשרים פפטידיים]] ב[[חלבון|חלבונים]]. השלשה הקטליטית של [[ציסטאין פרוטאז]]ות שונה רק בחומצה אמינית אחת מהשלשה של סרין פרוטאזות: החומצה האמינית [[ציסטאין]] מחליפה את סרין, וממלאת תפקיד דומה לה.
לעתים המושג שלשה קטליטית מתייחס גם לשלשות [[חומצת אמינו|חומצות אמינו]] אחרות הפועלות יחד ומקטלזות תגובות אחרות.
 
==מיקום השלשה הקטליטית במבנה החלבון==
השלשה הקטליטית נמצאת ב[[אתר פעיל|אתר הפעיל]] של [[אנזים|אנזימים]]. למרותעל ששלושתאף ששלוש חומצות האמינו בדרך כלל רחוקות אחת מהשנייה מבחינת רצף החלבון (ה[[מבנה ראשוני|מבנה הראשוני]]), בעקבות [[קיפול החלבון|קיפול חלבוןקיפולו]] למבנהומבנהו התלת -ממדית (ה[[מבנה שלישוני|מבנה השלישוני]]) נוצרשל החלבון נוצרת קרבה קירובמרחבית בין חומצות האמינו ופעילותםופעילותן כשלשה מתאפשרת.
 
==דוגמה לפעילות של שלשה קטליטית:==
[[כימוטריפסין]] הוא [[אנזים]] המבקע קשרים פפטידיים בעזרת שלשה קטליטית המורכבת מסרין-195, היסטדין-57 ואספרטט-102. שלוש חומצות האמינו פועלות יחד ומבקעות את הקשר הפפטידי.
 
מנגנון פעולה זוזה מתרחש במספר שלבים:
* יצירת [[נוקלאופיל]]: עצם קישור ה[[סובסטרט]] לאתר הפעיל גורם לשינויי [[קונפורמציה]] קטנים, שיוצרים עדיפות להעברת [[פרוטון]] מסרין להיסטדין., (היסטדין פועלתשפועלת כ[[בסיס (כימיה)|בסיס]]). כתוצאההחומצה מכךהאמינית סרין מאוקטבתהופכת והופכתלבסיס לנוקלאופיל(נוקלאופיל).
* סרין פועלת כנוקלאופיל: סריןהסרין המאוקטבתשאוקטבה תוקפת את הפחמן הקרבוניליב[[קצה קרבוקסילי|קצה הקרבוקסילי]] של ה[[סובסטרט]] ונוצר תוצר ביניים [[טטרהדר]]אלי, לא יציב, בעל מטען שלילי המיוצב על ידי [[קשר מימן|קשרי מימן]] עם [[חורOxyanion לאוקסיאניון]]Hole.
* יצירתהוצאה קצהשל אמיניהשרשרת המפורקת: תוצר הביניים מתפרק כך שהפחמן וה[[חמצן קרבונילי|חמצן הקרבונילי]] נשארים קשורים לכימוטרפסין, בזמן שהחומצה האמינית היסטדין פועלת כ[[חומצה]] ומוסרת [[פרוטון]] לאמיןל[[אמין]] בקשרשל ה[[קשר פפטידי|קשר הפפטידי]] והקשר האמיניהפפטידי נשבר, כלומר נוצר קצה אמיני חדש.
* מגיעה מולקולת מים: החומצה האמינית היסטדין לוקחתקוטפת פרוטון ממולקולת המים ומאקטבת אותה. ה[[הידרוקסיל]] של המיםשנותר פועל כ[[נוקלאופיל]] ותוקף את הפחמן הקשורשנותר קוולנטיתקשור לאנזיםלכימוטרפסין. שוב נוצר מצב ביניים טטרהדראלי עם אנרגיה גבוהה אשר מיוצב על ידי אוקסיאניוןה-Oxyanion הולHole.
* יצירת [[קצה קרבוקסילי]]: היסטדין מחזירה לסרין את הפרוטון וכך עוזרת לנתק את הפחמן הקרבונילי, נוצר קצה קרבוקסילי חדש והאנזיםוהשרשרת מתנתקהחלבונית כולומתנתקת מהכימוטרפסין.
 
==ראו גם==
* [[סרין פרוטאז]] ו-
* [[ציסטאין פרוטאז]].
* [[חור לאוקסיאניון]].
* [[קטליזה אנזימתית]].
 
[[קטגוריה:ביוכימיה]]