עץ פילוגנטי – הבדלי גרסאות

תוכן שנמחק תוכן שנוסף
Adi.mano (שיחה | תרומות)
←‏היסטוריה: הוספת פסקה על מקור המושג "עץ החייים"
Adi.mano (שיחה | תרומות)
עדכון ה"היסטוריה"
שורה 13:
מקור הרעיון של "[https://he.wikipedia.org/w/Tree_of_life_(science) עץ החיים]" הוא במושג העתיק של התקדמות מצורות חיים נמוכות לצורות חיים גבוהות יותר (כמו ב[https://he.wikipedia.org/w/Great_Chain_of_Being שרשרת ההווייה הגדולה]). ניתן למצוא ייצוגים מוקדמים של עצים פילוגנטיים מסועפים, כולל "תרשים פלואונטולוגי" המראה את היחסים הגיאולוגיים בין צמחים ובעלי חיים בספר "Elementary Geology", מאת אדוארד היצ'קוק (מהדורה ראשונה: 1840).
 
אחד העצים הפילוגנטיים הראשונים והנודעים ביותר שצוירו היה של [[צ'ארלס דרווין]] בספרו [[מוצא המינים]] (1859). הביולוגיה ה[[אבולוציה|אבולוציונית]] עדיין משתמשת בעץ הפילוגנטי לתיאור אבולוציה של יצוריםהאבולוציה, כיוון שעצים אלה מעבירים בצורה יעילה את [[היווצרות המינים]] שנוצרה תוך כדי [[הסתגלות אבולוציונית|הסתגלות של מינים]] ופיצוליםופיצולי שושלות אקראיים למחצה. במשך הזמן, סיווג מינים הפך בהמשךלדינמי השניםיותר.
[[קובץ:Neomuratree.svg|ממוזער|עץ פילוגנטי מושרש, הממחיש כיצד איקריוטים וארכאונים קשורים באופן הדוק יותר זה לזה מאשר [[חיידקים]]. [https://he.wikipedia.org/w/Neomura Neomura] הוא [[קלייד]] המורכב משתי על ממלכות - [[ארכאונים]] ו[[איקריוטים]]. LUCA מייצג את [[האב הקדמון הכולל]].]]
אחד התורמים המשמעותיים לתחום של בניית עצים פילוגנטיים היה [[וילי הניג]] ותרומתיו החשובות ביותר היו השיטה של בדיקת [[הומולוגיה (ביולוגיה)|הומולוגיות]] בין יצורים באמצעות דמיון מורש בין יצורים (כולל [[ריצוף DNA]], בדיקת התנהגות, בדיקות מורפולוגיות וכו') וכן הדגשתו לבדיקת העבר של היצור בעיקר בעזרת מאובנים.
 
בתחוםעם התפתחות תחום ה[[ביואינפורמטיקה]], ניתן כיום לבנות עץ פילוגנטי בהינתן מספר רצפים ידועים של מולקולות בעלות תפקוד זהה, כגון רצפי DNA אשר מקודדים לחלבון משותף בין מינים שונים. ה[[אלגוריתם של פיץ']] וה[[אלגוריתם של סנקוף']] הם אלגוריתמים אשר עושים זאת. לשם כך הם משתמשים בשיטת ה[[small parsimony]], אשר מוצאת את האב הקדמון המשותף הסביר ביותר בהינתן עץ נתון, והיא מסתמכת על [[large parsimony]] אשר למעשה מבצעת בדיקת small parsimony על כל העצים האפשריים.בשנת 2001 רות צ׳רני ביחד עם [[קרן ווגטמן]] פיתחו אלגוריתם לחישוב מדויק של העצים הללו.
 
==ראו גם==
שורה 23:
* [[עץ פילוגנטי מושלם]]
* [[קלייד]]
* [[אלגוריתם של סנקוף']]
* [[אלגוריתם של פיץ']]
 
==קישורים חיצוניים==