ניאו – הבדלי גרסאות

משבר האמונה של ניאו מגיע לנקודת שיא כאשר, לאחר שהצליח לשחרר את מורפיוס משבי "הסוכנים" אך בעצמו נלכד במטריקס, הוא נאלץ להמלט מ"הסוכנים" לעבר נקודת יציאה מרוחקת. ניאו נלחם ב"סוכן" סמית' ומצליח להדפו, דבר שאיש מבני האדם הלוחמים לא הצליח לפניו, אך לא להביסו. כבר בעת קרב זה מכריז מורפיוס, הצופה בקרב באמצעות מסך מחוץ למטריקס, כי ניאו "מתחיל להאמין". מכיוון שלא הצליח לחסל את "הסוכן" ניאו בורח ממנו לעבר נקודת היציאה, אך זה מקדים אותו, יורה בו והורגו. טריניטי, הצופה במתרחש יחד עם מורפיוס, ניגשת לגופו הדומם המחובר למציאות המדומה של ניאו, נושקת לו ואומרת לו כי היא מאמינה שהוא "האחד", שכן היא אוהבת אותו - כפי ש"הנביאה" חזתה עבורה. או אז ניאו אכן עובר מהפך - על אף שבתחילה הוא אכן מת, הוא מצליח להתגבר על האמונה כי הדברים שנגרמו לו במציאות המדומה במטריקס הם אמיתיים וממשיך להלחם. הפעם הוא מצליח לא רק "לעקם" את החוקים השולטים בעולם ההדמיה כפי שעשה עד כה, כאשר נע במהירות רבה או הכה בחוזקה, אלא ממש לשבור אותם. הוא מצליח לעצור כדורי אקדח ב[[תאוצה|תאוצתם]] ולבסוף אף להרוג את "הסוכנים".

 

בסרטים אלו ניאו הוא דמות שונה במקצת. כעת הוא כבר בטוח ביכולתו לעוות את חוקי המטריקס ולפיכך כמעט ואין הגבלות לדברים להם הוא מסוגל בעולם הווירטואלי תוך התעלמות מחוקיו, כגון תעופה, תנועה במהירות גבוהה, יכולת ריפוי, [[טלקינזיס]], יכולת לראות דרך עצמים מוצקים ואף לזהות שינויים ב[[קוד תוכנה|קוד]] שמרכיב את העולם המדומה.

 

עם יציאתו מהעולם הווירטואלי של "המטריקס" מותקפים ניאו וחבריו על ידי מכונות המכונות "זקיפים". במהלך המאבק מגלה ניאו כי כוחותיו המשיחיים פועלים גם בעולם האמיתי וביכולתו להשמיד את אותם "זקיפים" בכוח המחשבה.

 

ניאו מחליט על דרכו, כפי שהוטוותה בידי "הנביאה" - להפסיק את המלחמה. בזמן שבני האדם ב"ציון" נערכים למלחמה כנגד צבא המכונות הקרב ניאו וטריניטי יוצאים לעיר המכונות במטרה להציע עסקה - ניאו יפטור את המכונות ואת המטריקס מה"סוכן סמית'", אשר הפך לוירוס אשר הורס את המטריקס ובכך מסכן גם את המכונות, בתנאי שאלו יחדלו ממלחמתם בבני האדם.