תוכן שנמחק תוכן שנוסף
אין תקציר עריכה
שורה 6:
 
== סוגי ה-LINE-ים השונים ==
בהתבסס על המבנה [[פילוגנטיקה|והפילוגנזה]] של [[חלבון|החלבון]] העיקרי של הרצף [[רוורס טרנסקריפטאז]] רצפי ה-LINE מחולקים ל-5 קבוצות עיקריות. L1, RTE, R2, I ו-Jockey. שניתן לסוג בסיווגים משניים לפחות ל-28 [[קליידענף (פילוגנטיקה)|ענפים]]{{הערה|{{צ-מאמר|מחבר=Vladimir V. Kapitonov, Sébastien Tempel, Jerzy Jurka|שם=Simple and fast classification of non-LTR retrotransposons based on phylogeny of their RT domain protein sequences|כתב עת=Gene|כרך=448|עמ=207–213|שנת הוצאה=2009-12-15|doi=10.1016/j.gene.2009.07.019|קישור=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/19651192}}}}. כיום רק הרצף LINE1 פעיל בגנום האנושי, וגם זה רק במיעוטו. רצף זה מצוי בכל [[יונקים|היונקים]] והוא הרצף הנפוץ בגנום האדם (כ-17% מכלל הגנום). שאר הרצפים נמצאים בכמויות קטנות יותר{{הערה|{{צ-מאמר|מחבר=Wesley C. Warren, LaDeana W. Hillier, Jennifer A. Marshall Graves, Ewan Birney|שם=Genome analysis of the platypus reveals unique signatures of evolution|כתב עת=Nature|כרך=453|עמ=175–183|שנת הוצאה=2008-05-08|doi=10.1038/nature06936|קישור=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/18464734}}}}{{הערה|{{צ-מאמר|מחבר=E. S. Lander, L. M. Linton, B. Birren, C. Nusbaum|שם=Initial sequencing and analysis of the human genome|כתב עת=Nature|כרך=409|עמ=860–921|שנת הוצאה=2001-02-15|doi=10.1038/35057062|קישור=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11237011}}}}.
 
בגנום [[צומח|הצמחי]] נמצאו עד כה רצפים מענפים L1 ו-RTE. כאשר רצף L1 מאוד מגוון{{הערה|{{צ-מאמר|מחבר=V. Zupunski, F. Gubensek, D. Kordis|שם=Evolutionary dynamics and evolutionary history in the RTE clade of non-LTR retrotransposons|כתב עת=Molecular Biology and Evolution|כרך=18|עמ=1849–1863|שנת הוצאה=2001-10-01|קישור=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/11557792}}}}, ואילו הרצף RTE מאוד שמור עד כדי זהה בתוך אותה משפחה{{הערה|{{צ-מאמר|מחבר=Georgy Smyshlyaev, Franka Voigt, Alexander Blinov, Orsolya Barabas|שם=Acquisition of an Archaea-like ribonuclease H domain by plant L1 retrotransposons supports modular evolution|כתב עת=Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America|כרך=110|עמ=20140–20145|שנת הוצאה=2013-12-10|doi=10.1073/pnas.1310958110|קישור=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/24277848}}}}.