דיכוי פלואורסצנטי – הבדלי גרסאות
תוכן שנמחק תוכן שנוסף
שמואל בורג (שיחה | תרומות) מ שמואל בורג העביר את הדף טיוטה:דיכוי פלואורסצנטי לשם דיכוי פלואורסצנטי: סיום עריכה כטיוטה |
שמואל בורג (שיחה | תרומות) |
||
שורה 2:
[[ריווי פלואורסצנטי|ריווי]] או [[דיכוי פלואורסצנטי]] ('''Quenching''' ב[[אנגלית]]) מתייחס לכל תהליך שמוריד את עוצמת הקרינה ה[[פלואורסצנציה|פלואורסצנטית]] של חומר נתון. מגוון תהליכים יכולים לגרום ל[[רלקסציה]], כמו תגובות ל[[מצב מעורר]], העברת אנרגיה, יצירת [[קומפלקס (כימיה)|קומפלקסים]] או התנגשות אלקטרונים. כתוצאה מכך, [[דיכוי פלואורסצנטי]] תלוי לעתים קרובות מאוד ב[[לחץ]] וב[[טמפרטורה]]. [[חמצן מולקולרי|חמצן מולקולרי,]] [[יוד|יוני יוד]] ו[[אקרילאמיד]]<ref>{{צ-מאמר|מחבר=Phillips SR, Wilson LJ, Borkman RF|שם=Acrylamide and iodide fluorescence quenching as a structural probe of tryptophan microenvironment in bovine lens crystallins|כתב עת=Current Eye Research|כרך=5|עמ=611-620|סדרה=8|שנת הוצאה=[[1986]]|doi=10.3109/02713688609015126|קישור=https://www.tandfonline.com/doi/abs/10.3109/02713688609015126}}</ref> הם מדכאים כימיים נפוצים. [[יון]] ה[[כלוריד]] הוא מדכא ידוע ל[[פלואורסצנציה|פלואורסצנצית]] [[כינין]].<ref>{{צ-מאמר|מחבר=J. E. O'Reilly|שם=Fluorescence experiments with quinine|כתב עת=Journal of Chemical Education|כרך=52|סדרה=9|עמ=610-612|שנת הוצאה=[[1975]]|קישור=https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ed052p610|doi=10.1021/ed052p610}}</ref><ref>{{צ-מאמר|מחבר=Sacksteder L, Ballew RM, Brown EA, Demas JN, Nesselrodt D, DeGraff BA|שם=Photophysics in a disco: Luminescence quenching of quinine|כתב עת=Journal of Chemical Education|כרך=67|סדרה=12|עמ=1065|שנת הוצאה=[[1990]]|doi=10.1021/ed067p1065.|קישור=https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ed067p1065}}</ref><ref>{{צ-מאמר|מחבר=Gutow JH|שם=Halide (Cl-) Quenching of Quinine Sulfate Fluorescence: A Time-Resolved Fluorescence Experiment for Physical Chemistry|כתב עת=Journal of Chemical Education|כרך=82|סדרה=2|עמ=302|doi=10.1021/ed082p302|שנת הוצאה=[[2005]]|קישור=https://pubs.acs.org/doi/abs/10.1021/ed082p302}}</ref> [[דיכוי פלואורסצנטי]] מהווה בעיה ב[[ספקטרוסקופיה|שיטות ספקטרוסקופיות]] שאינן מיידיות, כגון [[פלואורסצנציה]] בהשראת [[לייזר]].
[[קובץ:Fig1.gif|ממוזער|250x250 פיקסלים|חפיפה [[הספקטרום האלקטרומגנטי|ספקטרלית]] של [[ספקטרום פליטה|פליטת]] התורם ו[[ספקטרום בליעה|בליעת]] המקבל]]ל[[דיכוי פלואורסצנטי]] נעשה שימוש בחיישני [[אופטוד]]; למשל אפקט הדיכוי של [[חמצן]] על [[קומפלקס (כימיה)|קומפלקסי]] [[רותניום]] מסוימים מאפשרת מדידה של ריווי [[חמצן]] ב[[תמיסה]]. [[דיכוי פלואורסצנטי]] הוא הבסיס ל[[אבחנה|תבחינים ביולוגיים]] של [[מעבר אנרגיה בתהודה פלואורסצנטית|העברת אנרגיית תהודה]] ([[FRET]]).<ref>{{צ-מאמר|מחבר=Peng X, Draney DR, Volcheck WM|שם=Quenched near-infrared fluorescent peptide substrate for HIV-1 protease assay|כתב עת=Optical Molecular Probes for Biomedical Applications|כרך=6097|עמ=60970F|קישור=https://www.spiedigitallibrary.org/conference-proceedings-of-spie/6097/1/Quenched-near-infrared-fluorescent-peptide-substrate-for-HIV-1-protease/10.1117/12.669174.short?SSO=1|שנת הוצאה=[[2006]]|doi=10.1117/12.669174}}</ref><ref>{{צ-מאמר|מחבר=Peng X, Chen H, Draney DR, Volcheck W, Schutz-Geschwender A, Olive DM|שם=A nonfluorescent, broad-range quencher dye for Förster resonance energy transfer assays|כתב עת=Analytical Biochemistry|כרך=388|סדרה=2|עמ=220-228|שנת הוצאה=[[2009]]|doi=10.1016/j.ab.2009.02.024|קישור=https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0003269709001274?via%3Dihub}}</ref><ref>{{צ-מאמר|מחבר=Osterman H|שם=The Next Step in Near Infrared Fluorescence:
IRDye® QC-1 Dark Quencher|כתב עת=Review Article|כרך=388|עמ=1-8|שנת הוצאה=[[2009]]}}</ref> דיכוי ואי-דיכוי פלואורסצנטי לאחר אינטראקציה עם יעד ביולוגי מולקולרי ספציפי הוא הבסיס ל[[חומר ניגוד|חומרי ניגוד]] [[אופטיקה|אופטיים]] פעילים ב[[דימות מולקולרי]].<ref>{{צ-מאמר|מחבר=Blum G, Weimer RM, Edgington LE, Adams W, Bogyo M|שם=Comparative Assessment of Substrates and Activity Based Probes as Tools for Non-Invasive Optical Imaging of Cysteine Protease Activity|כתב עת=PloS One|שנת הוצאה=[[2009]]|כרך=4|סדרה=7|עמ=e6374|doi=10.1371/journal.pone.0006374|קישור=https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC2712068/}}</ref><ref>{{צ-מאמר|מחבר=Weissleder R, Tung CH, Mahmood U, Bogdanov A|שם="In vivo imaging of tumors with protease-activated near-infrared fluorescent probes|כתב עת=Nature Biotechnology|כרך=17|סדרה=4|עמ=375-378|doi=10.1038/7933|שנת הוצאה=[[1999]]|קישור=https://www.nature.com/articles/nbt0499_375}}</ref>
שורה 10:
{{ערך מורחב|מעבר אנרגיה בתהודה פלואורסצנטית}}
[[קובץ:FRET_Jablonski_diagram.svg|קישור=https://he.wikipedia.org/wiki/%D7%A7%D7%95%D7%91%D7%A5:FRET_Jablonski_diagram.svg|טקסט=|ממוזער|[[דיאגרמת יבלונסקי]] של [[FRET]] עם ציון [[סקאלה|סקאלות]] ה[[זמן|זמנים]].]]
ישנם כמה מנגנונים מובחנים שבאמצעותם ניתן להעביר [[אנרגיה]] ללא [[קרינה אלקטרומגנטית|קרינה]] (ללא [[בליעה (קרינה אלקטרומגנטית)|בליעה]] או [[פליטה ספונטנית|פליטה]] של [[פוטונים]]) בין שני [[פלואורופור|צבענים]], תורם ומקבל. העברת אנרגיה בתהודה ([[FRET]]) היא מנגנון [[דיכוי פלואורסצנטי|דיכוי]] דינמי מכיוון שהעברת אנרגיה מתרחשת בזמן שהתורם במצב [[עירור|מעורר]]. [[FRET]] מבוסס על אינטראקציות דיפול-דיפול קלאסיות בין [[דיפול|דיפולי]] המעבר של התורם ומקבל והוא תלוי באופן קיצוני ב[[מרחק]] המקבל מהתורם, '''<math>R</math>''', נופל בקצב של '''<math>{1}/{R^{6}}</math>'''. [[FRET]] תלוי גם ב[[הספקטרום האלקטרומגנטי|חפיפה הספקטרלית]] של התורם ומקבל (ראה איור) ובנטייה היחסית של [[מומנט הדיפול של פלואורופור|מומנטי הדיפול]] של התורם והמקבל. [[FRET]] יכול בדרך כלל להתרחש על פני מרחקים של עד 100 [[אנגסטרום|אנגסטרם.]]
| |||