תרומבין

(הופנה מהדף טרומבין)
ערך זה זקוק לעריכה: הסיבה לכך היא: משפטים החוזרים על עצמם, הנושא לא ברור מספיק, הכתיבה טכנית מדי.
אתם מוזמנים לסייע ולתקן את הבעיות, אך אנא אל תורידו את ההודעה כל עוד לא תוקן הדף. אם אתם סבורים כי אין בדף בעיה, ניתן לציין זאת בדף השיחה.

תרומבין הוא אנזים הנמצא במערכת קרישת דם אצל בני אדם ובעלי חיים. תרומבין שייך לאנזימים מקבוצת הידרולאזות (סרין פרוטאז), שהם אנזימים המפרקים חלבונים. התרומבין הופך את הפיברינוגן מחלבון מסיס לחלבון לא מסיס המכונה פיברין, בסוף השלב של קרישת דם.

F2
2c93.png
מבנים זמינים
בנק מידע החלבוניםחיפוש אורתולוגים: PDBe RCSB
רשימת מבנים

1A2C, 1A3B, 1A3E, 1ABI, 1ABJ, 1AD8, 1AE8, 1AI8, 1AIX, 1AWF, 1AWH, 1AY6, 1B5G, 1B7X, 1BA8, 1BB0, 1BCU, 1BHX, 1BMM, 1BMN, 1BTH, 1C1U, 1C1V, 1C1W, 1C4U, 1C4V, 1C4Y, 1C5L, 1C5N, 1C5O, 1CA8, 1D3D, 1D3P, 1D3Q, 1D3T, 1D4P, 1D6W, 1D9I, 1DE7, 1DIT, 1DM4, 1DOJ, 1DWB, 1DWC, 1DWD, 1DX5, 1E0F, 1EB1, 1EOJ, 1EOL, 1FPC, 1G30, 1G32, 1G37, 1GHV, 1GHW, 1GHX, 1GHY, 1GJ4, 1GJ5, 1H8D, 1H8I, 1HAI, 1HAO, 1HAP, 1HBT, 1HLT, 1HUT, 1HXE, 1HXF, 1IHS, 1JMO, 1JOU, 1JWT, 1K21, 1K22, 1KTS, 1KTT, 1LHC, 1LHD, 1LHE, 1LHF, 1LHG, 1MH0, 1MU6, 1MU8, 1MUE, 1NM6, 1NRN, 1NRO, 1NRP, 1NRQ, 1NRR, 1NRS, 1NT1, 1NU7, 1NU9, 1NY2, 1NZQ, 1O0D, 1O2G, 1O5G, 1OOK, 1OYT, 1P8V, 1PPB, 1QBV, 1QHR, 1QJ1, 1QJ6, 1QJ7, 1QUR, 1RD3, 1RIW, 1SB1, 1SFQ, 1SG8, 1SGI, 1SHH, 1SL3, 1SR5, 1T4U, 1T4V, 1TA2, 1TA6, 1TB6, 1THP, 1THR, 1THS, 1TMB, 1TMU, 1TOM, 1TQ0, 1TQ7, 1TWX, 1UVS, 1VR1, 1VZQ, 1W7G, 1WAY, 1WBG, 1XM1, 1XMN, 1YPE, 1YPG, 1YPJ, 1YPK, 1YPL, 1YPM, 1Z71, 1Z8I, 1Z8J, 1ZGI, 1ZGV, 1ZRB, 2A0Q, 2A2X, 2A45, 2AFQ, 2ANK, 2ANM, 2B5T, 2BDY, 2BVR, 2BVS, 2BVX, 2BXT, 2BXU, 2C8Y, 2FEQ, 2FES, 2GDE, 2GP9, 2H9T, 2HGT, 2HNT, 2HPP, 2HPQ, 2HWL, 2JH0, 2JH6, 2OD3, 2PGB, 2PGQ, 2PW8, 2R2M, 2THF, 2ZFQ, 2ZFR, 2ZG0, 2ZHE, 2ZHF, 2ZHW, 2ZI2, 2ZIQ, 2ZNK, 2ZO3, 3B23, 3B9F, 3BEF, 3BEI, 3BF6, 3BIU, 3BIV, 3BV9, 3C1K, 3C27, 3D49, 3DA9, 3DD2, 3DT0, 3DUX, 3E6P, 3EE0, 3EQ0, 3F68, 3GIC, 3GIS, 3HAT, 3HKJ, 3HTC, 3JZ2, 3LDX, 3LU9, 3NXP, 3P17, 3P6Z, 3P70, 3PO1, 3QGN, 3QLP, 3QTO, 3QTV, 3QWC, 3QX5, 3R3G, 3RLW, 3RLY, 3RM0, 3RM2, 3RML, 3RMM, 3RMN, 3RMO, 3S7H, 3S7K, 3SHA, 3SHC, 3SI3, 3SI4, 3SQE, 3SQH, 3SV2, 3T5F, 3TU7, 3U69, 3U8O, 3U8R, 3U8T, 3U98, 3U9A, 3UTU, 3UWJ, 3VXE, 3VXF, 4BAH, 4BAK, 4BAM, 4BAN, 4BAO, 4BAQ, 4BOH, 4DIH, 4DII, 4DT7, 4DY7, 4E05, 4E06, 4E7R, 4H6S, 4H6T, 4HFP, 4HTC, 4THN, 5GDS, 7KME, 8KME, 1A46, 1A4W, 1A5G, 1A61, 1AFE, 1AHT, 1DWE, 1FPH, 1HAG, 1HAH, 1HDT, 1HGT, 1IHT, 1NO9, 1TBZ, 1TMT, 1UMA, 2C8W, 2C8X, 2C8Z, 2C90, 2C93, 2CF8, 2CF9, 2CN0, 2JH5, 2PKS, 2UUF, 2UUJ, 2UUK, 2V3H, 2V3O, 2ZC9, 2ZDA, 2ZDV, 2ZF0, 2ZFF, 2ZFP, 2ZGB, 2ZGX, 2ZHQ, 3DHK, 3EGK, 3JZ1, 3K65, 3PMH, 3QDZ, 4AX9, 4AYV, 4AYY, 4AZ2, 4CH2, 4CH8, 4HZH, 4I7Y, 4LOY, 4LXB, 4LZ1, 4LZ4, 4MLF, 4N3L, 4NZE, 4NZQ, 4O03, 4RKJ, 4RKO, 4RN6, 4YES, 4UD9, 4UDW, 4UE7, 4UEH, 5AF9, 5AFY, 5AFZ, 5AHG, 5CMX, 4UFD, 5EDM, 5E8E, 5EDK, 4UFE, 4UFG, 4UFF, 5A2M, 5JDU

מזהים
שמות נוספיםF2, PT, RPRGL2, THPH1, coagulation factor II, thrombin
מזהים חיצונייםOMIM: 176930 MGI: 88380 HomoloGene: 426 GeneCards: F2
מיקום הגן (באדם)
כרומוזום 11
כרומוזוםכרומוזום 11[1]
כרומוזום 11
מיקום גנומי עבור F2
מיקום גנומי עבור F2
עמדה11p11.2התחלה46,719,196 bp[1]
סוף46,739,506 bp[1]
מיקום הגן (בעכבר)
כרומוזום 2 (בעכבר)
כרומוזוםכרומוזום 2 (בעכבר)[2]
כרומוזום 2 (בעכבר)
מיקום גנומי עבור F2
מיקום גנומי עבור F2
עמדה2 E1|2 50.63 cMהתחלה91,625,320 bp[2]
סוף91,636,414 bp[2]
תבנית ביטוי RNA
PBB GE F2 205754 at fs.png
נתוני התבטאות נוספים
אונטולוגיית גנים (GO)
תפקיד מולקולרי calcium ion binding
היקשרות לקולטן
peptidase activity
פעילות הידרוליזה
growth factor activity
serine-type peptidase activity
thrombospondin receptor activity
GO:0001948 קשירת חלבונים
serine-type endopeptidase activity
lipopolysaccharide binding
heparin binding
GO:0010577 enzyme activator activity
מיקום בתא אקסוזום
blood microparticle
endoplasmic reticulum lumen
Golgi lumen
קרום התא
אזור חוץ תאי
חלל חוץ תאי
external side of plasma membrane
collagen-containing extracellular matrix
תהליכים ביולוגיים blood coagulation, intrinsic pathway
regulation of blood coagulation
positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling
positive regulation of collagen biosynthetic process
multicellular organism development
peptidyl-glutamic acid carboxylation
cellular protein metabolic process
acute-phase response
positive regulation of reactive oxygen species metabolic process
endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport
positive regulation of cell growth
cell surface receptor signaling pathway
בקרת גנים
positive regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol
בקרה חיובית של שגשוג תאים
leukocyte migration
negative regulation of fibrinolysis
positive regulation of blood coagulation
regulation of cytosolic calcium ion concentration
response to wounding
signal peptide processing
positive regulation of phospholipase C-activating G protein-coupled receptor signaling pathway
regulation of cell shape
עצירת דימום
negative regulation of proteolysis
negative regulation of platelet activation
negative regulation of astrocyte differentiation
positive regulation of protein phosphorylation
פיברינוליטים
קרישת דם
פרוטאוליזה
platelet activation
positive regulation of protein localization to nucleus
positive regulation of lipid kinase activity
regulation of complement activation
antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide
negative regulation of cytokine production involved in inflammatory response
בקרה על פעילות קולטנים
G protein-coupled receptor signaling pathway
positive regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT
blood coagulation, fibrin clot formation
מקורות: Amigo / QuickGO
אורתולוגים
מיניםאדםעכבר
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

NM_000506
NM_001311257

NM_010168

RefSeq (חלבון)

NP_000497

NP_034298

מיקום (UCSC)Chr 11: 46.72 – 46.74 MbChr 2: 91.63 – 91.64 Mb
חיפוש PubMed[3][4]
ויקינתונים
צפייה/עריכה נתוני אדםצפייה/עריכה נתוני עכבר

התרומבין לא מצוי בדם באופן רגיל אלא נוצר מפרותרומבין לפי הצורך. פרותרומבין נוצר בכבד בעזרת ויטמין K. הפיכת פרותרומבין לתרומבין תלויה בנוכחות יוני סידן והאנזים תרומבופלסטין.

מבנהעריכה

אנזים התרומבין התגלה על ידי החוקר האמריקאי סיגראס בשיטת הקריסטלוגרפיה. בטבע תרומבין הוא גליקופרוטאיד, המסה המולרית שלו היא 36000 גרם/מול והוא מכיל כ-4% פחמימות. מולקולת התרומבין מורכבת משתי שרשראות פוליפפטידיות עם קשר גופרי ביניהן. שרשרת A מורכבת מ-49 שיירים של חומצות אמינו ושרשרת שנייה B מ-265 שיירים. בשרשרת B נמצא האתר הפעיל של האנזים ורצף של חומצות אמינו הומולוגי למבנה של טריפסין וכימוטריפסין. תרומבין קיים בטבע בכמה צורות פעילות שנבדלות ביניהן במבנה שרשרת B.

תפקידעריכה

תרומבין עושה הידרוליזה על 4 קשרי ארגיניל-גליצין במולקולת פיברינוגן, אשר מתפרקת ל-4 פפטידים. לאחר מכן נוצר פיברין מונומר, שבמשך עושה פולימריזציה לגוש של פיברין הנמצא בטסית דם. בנוכחותו של התרומבין, מתרחשת הצטברות של טסיות דם והתקבצות של קריש דם. עודף יחסי של תרומבין מפעיל מערכת נוגדת קרישה על ידי כך שלמערכת הדם נכנס חומר הפרין ואקטיבטור פלזמוגן ששומר על דלילות הדם.

האתר הפעיל של תרומבין שמכיל קבוצה הידרוקסילית של סרין מעוכב על ידי דיזופרופילפטורפוספט ושאר המעכבים מאופיינים לקבוצות סרין פרוטאז, בנוסף הפרין או אנטיתרומבין III או מקרוגלובולין שנמצאים בפלזמה עושים אינאקטיבציה לתרומבין בדם.

קישורים חיצונייםעריכה

  מדיה וקבצים בנושא תרומבין בוויקישיתוף

הערות שולייםעריכה