ויקיפדיה

בנק מידע החלבונים – הבדלי גרסאות

עיון אינטראקטיבי בהיסטוריה
→ העריכה הקודמתהעריכה הבאה ←
תוכן שנמחק תוכן שנוסף
חזותיקוד ויקי
←‏פתיח: , תיקון קישור
מ ←‏תכולה: עדכון הנתונים
שורה 38:
 
==תכולה==
בנק מידע החלבונים מתעדכן פעם בשבוע (ביום שלישי). בדומה, האתר [http://www.rcsb.org/pdb/statistics/holdings.do PDB Current Holdings Breakdown] מתעדכן פעם בשבוע. נכון לשבוע של ה-1327 בינוארבדצמבר 2015 הכיל המאגר 105114,732569 מבנים של חלבונים שפוענחו על פי הפירוט הבא:
[[קובץ:Protein structure examples.png|שמאל|ממוזער|320px|דוגמאות למבנים של חלבונים מה-PDB (נוצרו על ידי תוכנת כימרה של אוניברסיטת UCSF)]]
 
שורה 50:
!סך-הכול
|-align="right"
|"|[[קריסטלוגרפיה באמצעות קרני רנטגן|עקיפה של קרני רנטגן]] || 8895,026636 || 1,598694 || 4,332817 || 4 || 93102,960151
|--bgcolor="#EFEFEF" align="right"
|[[NMR]] || 9,466840 || 1,104135 || 222231 || 78 || 1011,799214
|-align="right"
|"|[[מיקרוסקופ אלקטרוני]] || 522666 || 29 || 164227 || 0 || 715922
|--bgcolor="#EFEFEF" align="right"
|"|מעורב || 6883 || 3 || 2 || 1 || 7489
|-align="right"
|"|אחר || 161170 || 4 || 6 || 13 || 184193
|--bgcolor="#EFEFEF" align="right"
|סך הכול || 98106,243293 || 2,738865 || 45,726283 || 2526 || '''105114,732569'''
|}
:::ל-8391,534748 מבנים ב-PDB יש קובץ structure factor
:::ל-8,114531 מבנים יש קובץ NMR restraint
:::ל-12,871289 מבנים יש קובץ chemical shifts
:::ל-686901 מבנים ב-PDB יש קובץ מיפוי 3 ממדי המאוחסן ב-EM Data Bank
 
הטבלה מראה כי מרבית המבנים פוענחו על ידי עקיפה באמצעות קרני רנטגן, אבל בשנים האחרונות כ-10% מהמבנים נקבעים על ידי שימוש ב-NMR, ומספר נמוך מזה באמצעות [[מיקרוסקופ אלקטרוני]] או, ליתר דיוק, קריו-מיקרוסקופ אלקטרוני, שכן הדגימה נחקרת בטמפרטורה של [[חנקן נוזלי]] (הקלקה על המספרים בטבלה המוצגת באתר מראה דוגמאות למבנים שפוענחו בשיטה זו).
אוחזר מתוך "https://he.wikipedia.org/wiki/בנק_מידע_החלבונים"