מבנה שלישוני – הבדלי גרסאות
תוכן שנמחק תוכן שנוסף
←הקשר בין המבנה השלישוני לפעילות החלבון: עריכה טכנית : תיקון טעות תחביר קלה |
מ הוספת קישור לקיפול חלבונים |
||
שורה 45:
==ניבוי מבנים שלישוניים==
[[קובץ:Myoglobin.png|שמאל|ממוזער|200px|המבנה התלת-ממדי של [[מיוגלובין]]]]
עד היום טרם נמצאה דרך טובה לחזות מבנה שלישוני של חלבון על פי ריצפו, אם כי קיימות מספר שיטות בתחום ה[[ביואינפורמטיקה]] המאפשרות חיזוי של מבנים בעיקר על פי דמיון ברצף לחלבונים שמבנם ידוע. הקושי בניבוי המבנה השלישוני נובע ממספר אפשרויות הקיפול העצום של כל חלבון. קושי זה בא לידי ביטוי ב[[פרדוקס לוינתל]] המציין כי אם ניקח חלבון לא גדול במיוחד המורכב מכ-300 חומצות אמינו ולכל חומצת אמינו ישנן שלוש [[דרגות חופש]], חישוב פשוט מראה שיש לחלבון זה כ-3<sup>300</sup> אפשרויות קיפול שונות. לחלבון המנסה להתקפל על ידי חיפוש התצורה הנכונה באופן אקראי של ניסוי וטעייה, ייקח זמן העולה על [[גיל היקום]] כדי להגיע לקיפול הנכון. אך, למרות זאת, [[קיפול חלבונים]] בתוך ה[[תא]] לקונפורמציה הנכונה לוקח אך שניות מעטות. פרדוקס זה מדגיש את הקושי בניבוי מבנה החלבון, לאור הריבוי העצום של המבנים התאורטיים האפשריים.
הניבוי הראשון של המבנה המרחבי של חלבון גלובולרי היה על ידי [[דורותי ורינץ']], בשנת [[1930]], אולם במהרה התברר כי המודל שהוצע אינו תואם לתוצאות הניסויים שנערכו. כיום ניתן לנבא מבנים שלישוניים, באופן מוגבל, על ידי שיטות ביואינפורמטיות המנסות לחזות מבנים באמצעות שיקולי [[אנרגיה]] ובאמצעות [[הומולוגיה (ביולוגיה)|הומולוגיה]] לחלבונים אשר מבנם ידוע. העיקרון המנחה של שיטות ביואינפורמטיות אלו הוא שדמיון רצפי גבוה (מעל 30 אחוז) בין החלבון שמבנהו אינו ידוע לחלבון בעל מבנה ידוע מאפשר להשתמש במבנה הקיים כבסיס למבנה החלבון הלא ידוע. פונקציות אנרגיה משמשות להתאמת מבנה זה לרצף של החלבון המבוקש.
| |||