פרוטאזום – הבדלי גרסאות

תוכן שנמחק תוכן שנוסף
הוספת הפנייה להערה קיימת
שורה 10:
== מערכת האוביקוויטין-פרוטאזום ==
=== תהליך היצמדות האוביקוייטין לחלבון המיועד לפירוק ולפרוטאזום ===
תהליך פירוק החלבונים על ידי מערכת זו מתחיל על ידי הצמדת שרשרת המורכבת מממספר יחידות של חלבון האוביקוויטין (Ubiquitin) לחלבון המיועד לפירוק. שרשרת זו משמשת כ"תגית זיהוי" ואישור לכך שהחלבון המסומן יכול להתפרק על ידי הפרוטיאוזום. תהליך ההצמדה של האוביקוויטין לחלבון נעשה במספר שלבים על ידי שלושה אנזימים .E3, E2, E1 :לכל אחד מאנזימים אלו יש תפקיד ייחודי בחיבור הספציפי של האוביקוויטין לחלבון המטרה המיועד לפירוק.<ref name=":0"Regulation>{{צ-מאמר|מחבר=Schmidt, M., & Finley, D|שם=Regulation of proteasome activity in health and disease.|כתב עת=Biochimica et Biophysica Acta (BBA) – Molecular Cell Research}}</ref>
 
השלב הראשון מבוצע על ידי האנזים הE1 ההופך את האוביקוויטין לפעיל מבחינה כימית בתהליך תלוי ATP. במצב פעיל זה האוביקוויטין נקשר לאנזים E2, ויחד הם נקשרים לאנזים הE3  הקרוי [[ליגאז]] האוביקוויטין (Ubiquitin ligase). קומפלקס זה מקשר באופן ספציפי בין מולקולת האוביקוויטין ל[[סובסטרט]]. במהלך קישור זה, מולקולת האוביקוויטין מועברת מאנזים ה- E2 ונקשרת לסובסטרט. באופן דומה תהליך זה יכול להתבצע מספר פעמים, עד ליצירת שרשרת המורכבת ממספר יחידות אוביקוויטין אשר יכולה לעבור צימוד לחלבון המטרה, או לחלופין בנייה של השרשרת על גבי חלבון.
שורה 27:
- 19Sיחידת הבקרה.
 
ה-19S מבצעת שלוש פעולות עיקריות הקובעות את קצב הפעילות של הפרוטיאוזום השלם [1]{{הערה|שם=Regulation}}:
* '''זיהוי האוביקוויטין ופתיחת השער:''' ה19S מתפקד כ"שער" המוביל ליחידה הקטליטית של הפרוטיאוזום (ה-20S). ה 19S מזהה את שרשרת האוביקוויטין שעל גבי הסובטרט ובכך קובע את הכוונתו ליחידה הקטליטית. תהליך הכניסה של הסובטרט ליחידה הקטליטית מחייב פתיחה של השער המפריד בינה לבין הסובסטרט.
* '''התרת/פתיחת מבנה הסובסטרט החלבוני:''' חלבונים בתא הן במצב מקופל בו יש להם מבנה תלת-ממדי  וחלקיהם הפנימיים קבורים ומוסתרים מפני הסביבה המקיפה אותם. כדי לפרק חלבונים יש צורך בהתרת המבנה שלהם וחשיפת השרשרת הפולי-פפטידית שלהם, כך שתהיה נגישה ליחידה הקטליטית. פתיחה והתרת המבנה של חלבון המטרה מבוצעת על ידי ה,19S- תוך כדי השקעת אנרגיה המתקבלת מפירוק מולקולות ATP.
שורה 41:
* פרוטאזת [[טריפסין|הטריפסין]] β2, (Trypsine) על חיתוך החלקים הבסיסיים בסובסטרט.
* '''פ'''רוטאזת [[כימוטריפסין|הכימו-טריפסין]], β5 ,(Chymotrypsin) אחראית על חיתוך החלקים [[הידרופוביות|ההידרופוביים]] מהחלבו'''ן.'''
* פרוטאזת [[קספאז|הקספאז]] β1 ,(Caspase), האחראי על חיתוך חלקים חומציים מהחלבון.<ref name=":0"Regulation />
 
==קישורים חיצוניים==