מעגל קרבס – הבדלי גרסאות

אקוניטאז מפעיל מנגנון [[דהידרציה]]-[[הידרציה]], כאשר באתר הפעיל מעורב בקטליזה [[צבר אטומים|צבר]] אטומי [[ברזל]]-[[גפרית]] [4Fe-4S]{{הערה|1=באופן כללי, האנזים מורכב מ-4 דומיינים וקיים ב-2 צורות: פעיל ולא פעיל. בצורה הלא פעילה, שלושת הדומיינים הראשונים מעורבים באינטרקציותבאינטראקציות הדוקות עם צבר ה-[3Fe-4S] בעל מבנה הקוביה שבאתר הפעיל בעוד שהדומיין הרביעי קשור באינטרקציותבאינטראקציות חלשות יותר באמצעות [[פפטיד]] מוארך; ובצורה הפעילה, האנזים קושר אטום ברזל נוסף ויוצר צבר [4Fe-4S]. ראו [[#Lauble et al. (1992)|Lauble et al. (1992)]], p. 2736}}; השיירים הקטליטיים המעורבים באתר הפעיל הם His¹⁰¹ ו-Ser⁶⁴², ומלבדם קיימים לפחות 21 שיירי חומצות אמינו נוספים המעורבים בזיהוי הסובסטרט, ייצוב מבנה ה-[4Fe-4S] ועוד.{{הערה|1=[[#Lauble et al. (1992)|Lauble et al. (1992)]], p. 2735}}

# דה-קרקבוקסילציה של אוקסלוסוקצינאט: החמצן שקשור לקבוצת הקרבוניל מותקף על ידי שייר [[טירוזין]] ועובר דה-פרוטונציה, וגורם לשחרור פחמן דו-חמצני מפחמן בטא (C#3) כקבוצה עוזבת. האלקטרונים נעים לעבר פחמן אלפא, יוצרים קשר כפול בין פחמנים אלפא ובטא ומפרקים את הקשר הכפול של הקרבוניל; משם נעים לאטום החמצן של קבוצת הקטון (החמצן הקשור לפחמן אלפא) וטוענים אותו מטען שלילי. זוג האלקטרונים הבלתי קושרים שעל פחמן אלפא אוסף מימן משייר ליזין סמוך. בשלב זה המולקולה השתנתה מצורת הקטו של האקוסלוסוקצינאט לצורת האנול, ויצרה יון אנולט. בשתי הצורות, הן בצורת הקטו (לפני עזיבת הפחמן הדו-חמצני) והן בצורת האנול, יון המגנזיום/מנגן בעל המטען החיובי הדו ערכי יוצר אינטרקציהאינטראקציה עם אטומי החמצן הטעונים מטען שלילי ומייצב את המולקולה.