קוד היסטונים – הבדלי גרסאות
תוכן שנמחק תוכן שנוסף
מ מאד-מאוד (דרך WP:JWB) |
אין תקציר עריכה |
||
שורה 13:
===מודיפקציות===
[[קובץ:MODIFICATION HISTONE CODE.png|שמאל|ממוזער|300px|דוגמאות למודיפיקציות אפשריות]]
חלק מהמודיפיקציות הידועות כוללות:
* [[מתילציה]] - שיירי ליזין וארגנין ידועים כחומצות אמינו אשר עוברות מתילציה. ליזין אשר עברו מתילציה בן הסמנים המוכרים ביותר בכל בנוגע לקוד ההיסטונים, שכן שיירי [[ליזין]] כאלו תואמים בצורה ניכרת [[ביטוי גנים|רמות ביטוי]] של גנים. מתילציה של שיירי הליזין H3K4 ו-H3K36 נמצאת בהתאמה לאקטיבציה של תהליך השעתוק, בעוד שדה-מתילציה של H3K4 מצביעה על השתקה של האזור בגן.
שורה 22 ⟵ 23:
* ישנם עוד הרבה מודיפיקציות אפשריות להיסטונים ו[[מחקר]] רב נעשה בנושא.
=== נומנקלטורה ===
צורת הכתיבה של המודיפקציות מורכבת מכמה חלקים:
* שם ההיסטון (לדוגמה, H3).
* אות אחת שמסמלת את [[חומצת אמינו|חומצת האמינו]], ומספר המייצג את המיקום בחלבון שבו חומצה אמינו זו ממוקמת (לדוגמה, האות K מייצגת את [[ליזין]]).
* אות או שתיים המייצגות את סוג המודיפקציה (לדוגמה, Me - מתילציה, Ac - אצתילציה, P - פוספורילציה, Ub - אוביקוויטינציה).
* מספר המייצג את כמות המודיפיקציות במיקום שצוין. חלק זה נמצא רק במודיפקציות מסוג מתילציה, מכיוון שיכול להיות חד, דו או תלת מתילציה.
H3K4me3 מייצג תלת מתילציה בליזין מספר 4 הנמצא על גבי היסטון H3.
==המורכבות של קוד ההיסטונים==
בניגוד למודל המופשט הזה, ל[[קוד גנטי|קוד]] עצמו יש פוטנציאל להיות מורכב ביותר. כל אחד מארבעת ההיסטונים הבסיסיים יכול לעבור מודיפיקציות שונות ובמס' אזורים שונים בו-זמנית. לדוגמה, בהיסטון H3 ישנם 19 שיירי [[ליזין]] הידועים כעוברים מודיפיקציות, וכל אחד יכול לעבור דה-, מונו-, די- או טרי-[[מתילציה]]. בהנחה ומודיפיקציות אלה אינן תלויות זו בזו, ישנם 4<sup>19</sup> (כ-280 מיליארד) [[שינוי (תהליך)|וריאציות]] אפשריות, הרבה יותר ממספר ההיסטונים המרבי בגנום האנושי ((6.4Gb / ~150bp = ~44 מיליון, בהנחה שהם דחוסים). כל זה עוד לפני שהתחשבנו באצתילציה של [[ליזין]] (9 שיירים ב-H3), [[מתילציה]] של ארגנין (ידועים 3 ב-H3) או [[פוספורילציה]] של [[תריאונין]], [[סרין]] [[טירוזין|וטירוזין]] (ידועים 8 כאלו ב-H3) וכן מודיפיקציות של היסטונים נוספים.
כל [[נוקלאוזום]] ב[[תא]] יכול להיות בעל סט שונה של מודיפיקציות, דבר שמעלה השערה בדבר קיומם של [[דפוס]]ים נפוצים של מודיפיקציות אלו. מחקרים שנערכו לאחרונה על כ-40 מודיפיקציות על פני [[פרומוטור]]ים של ה[[גנום האדם|גנום האנושי]], הראו שקיימים למעלה מ-4000 צירופים שונים, כאשר למעלה מ-300 מהן מתרחשות על פרומוטר יחיד. לעומת זאת, התגלו דפוסים המכילים סט של 17 מודיפיקציות אשר יחד חזרו על עצמם בלמעלה מ-3000 [[גן (ביולוגיה)|גנים]]. לפיכך, דפוסים של מודיפיקציות להיסטונים אכן קיימים אך הם מאוד מורכבים וכיום יש לנו את הידע ה[[ביוכימיה|ביוכימי]] המדויק אודות חשיבותם של חלק קטן יחסית של מודיפיקציות אלו.
להלן טבלה המסכמת את הקשר שבין קוד ההיסטונים ומצב ה[[שעתוק (ביולוגיה)|שעתוק]]:
{| class="wikitable"
|-
! rowspan="2" | סוג המודיפיקציה !! colspan="8" | היסטון
|-
!H3K4 || H3K9 || H3K14 || H3K27 || H3K79 || H3K122 || H4K20 || H2BK5
|-
| חד-[[מתילציה]] || הפעלה || הפעלה || || הפעלה || הפעלה || || הפעלה || הפעלה
|-
| דו-מתילציה || דיכוי || דיכוי || || דיכוי || הפעלה || || ||
|-
| תלת-מתילציה || הפעלה || דיכוי || || דיכוי || הפעלה ודיכוי || || || דיכוי
|-
| אצטלציה || || הפעלה || הפעלה || הפעלה || || הפעלה || ||
|}
==ראו גם==
| |||