תרומבין

תרומבין היא מולקולה חלבונית קריטית לשלב הסופי במנגנון קרישת דם אצל בני אדם ובעלי חיים. תרומבין פועל כאנזים ומשתייך לאנזימים מקבוצת ההידרולאזות (סרין פרוטאז), שהם אנזימים המפרקים חלבונים.

F2
מבנים זמינים בנק מידע החלבונים חיפוש אורתולוגים: PDBe RCSB רשימת מבנים 1A2C, 1A3B, 1A3E, 1ABI, 1ABJ, 1AD8, 1AE8, 1AI8, 1AIX, 1AWF, 1AWH, 1AY6, 1B5G, 1B7X, 1BA8, 1BB0, 1BCU, 1BHX, 1BMM, 1BMN, 1BTH, 1C1U, 1C1V, 1C1W, 1C4U, 1C4V, 1C4Y, 1C5L, 1C5N, 1C5O, 1CA8, 1D3D, 1D3P, 1D3Q, 1D3T, 1D4P, 1D6W, 1D9I, 1DE7, 1DIT, 1DM4, 1DOJ, 1DWB, 1DWC, 1DWD, 1DX5, 1E0F, 1EB1, 1EOJ, 1EOL, 1FPC, 1G30, 1G32, 1G37, 1GHV, 1GHW, 1GHX, 1GHY, 1GJ4, 1GJ5, 1H8D, 1H8I, 1HAI, 1HAO, 1HAP, 1HBT, 1HLT, 1HUT, 1HXE, 1HXF, 1IHS, 1JMO, 1JOU, 1JWT, 1K21, 1K22, 1KTS, 1KTT, 1LHC, 1LHD, 1LHE, 1LHF, 1LHG, 1MH0, 1MU6, 1MU8, 1MUE, 1NM6, 1NRN, 1NRO, 1NRP, 1NRQ, 1NRR, 1NRS, 1NT1, 1NU7, 1NU9, 1NY2, 1NZQ, 1O0D, 1O2G, 1O5G, 1OOK, 1OYT, 1P8V, 1PPB, 1QBV, 1QHR, 1QJ1, 1QJ6, 1QJ7, 1QUR, 1RD3, 1RIW, 1SB1, 1SFQ, 1SG8, 1SGI, 1SHH, 1SL3, 1SR5, 1T4U, 1T4V, 1TA2, 1TA6, 1TB6, 1THP, 1THR, 1THS, 1TMB, 1TMU, 1TOM, 1TQ0, 1TQ7, 1TWX, 1UVS, 1VR1, 1VZQ, 1W7G, 1WAY, 1WBG, 1XM1, 1XMN, 1YPE, 1YPG, 1YPJ, 1YPK, 1YPL, 1YPM, 1Z71, 1Z8I, 1Z8J, 1ZGI, 1ZGV, 1ZRB, 2A0Q, 2A2X, 2A45, 2AFQ, 2ANK, 2ANM, 2B5T, 2BDY, 2BVR, 2BVS, 2BVX, 2BXT, 2BXU, 2C8Y, 2FEQ, 2FES, 2GDE, 2GP9, 2H9T, 2HGT, 2HNT, 2HPP, 2HPQ, 2HWL, 2JH0, 2JH6, 2OD3, 2PGB, 2PGQ, 2PW8, 2R2M, 2THF, 2ZFQ, 2ZFR, 2ZG0, 2ZHE, 2ZHF, 2ZHW, 2ZI2, 2ZIQ, 2ZNK, 2ZO3, 3B23, 3B9F, 3BEF, 3BEI, 3BF6, 3BIU, 3BIV, 3BV9, 3C1K, 3C27, 3D49, 3DA9, 3DD2, 3DT0, 3DUX, 3E6P, 3EE0, 3EQ0, 3F68, 3GIC, 3GIS, 3HAT, 3HKJ, 3HTC, 3JZ2, 3LDX, 3LU9, 3NXP, 3P17, 3P6Z, 3P70, 3PO1, 3QGN, 3QLP, 3QTO, 3QTV, 3QWC, 3QX5, 3R3G, 3RLW, 3RLY, 3RM0, 3RM2, 3RML, 3RMM, 3RMN, 3RMO, 3S7H, 3S7K, 3SHA, 3SHC, 3SI3, 3SI4, 3SQE, 3SQH, 3SV2, 3T5F, 3TU7, 3U69, 3U8O, 3U8R, 3U8T, 3U98, 3U9A, 3UTU, 3UWJ, 3VXE, 3VXF, 4BAH, 4BAK, 4BAM, 4BAN, 4BAO, 4BAQ, 4BOH, 4DIH, 4DII, 4DT7, 4DY7, 4E05, 4E06, 4E7R, 4H6S, 4H6T, 4HFP, 4HTC, 4THN, 5GDS, 7KME, 8KME, 1A46, 1A4W, 1A5G, 1A61, 1AFE, 1AHT, 1DWE, 1FPH, 1HAG, 1HAH, 1HDT, 1HGT, 1IHT, 1NO9, 1TBZ, 1TMT, 1UMA, 2C8W, 2C8X, 2C8Z, 2C90, 2C93, 2CF8, 2CF9, 2CN0, 2JH5, 2PKS, 2UUF, 2UUJ, 2UUK, 2V3H, 2V3O, 2ZC9, 2ZDA, 2ZDV, 2ZF0, 2ZFF, 2ZFP, 2ZGB, 2ZGX, 2ZHQ, 3DHK, 3EGK, 3JZ1, 3K65, 3PMH, 3QDZ, 4AX9, 4AYV, 4AYY, 4AZ2, 4CH2, 4CH8, 4HZH, 4I7Y, 4LOY, 4LXB, 4LZ1, 4LZ4, 4MLF, 4N3L, 4NZE, 4NZQ, 4O03, 4RKJ, 4RKO, 4RN6, 4YES, 4UD9, 4UDW, 4UE7, 4UEH, 5AF9, 5AFY, 5AFZ, 5AHG, 5CMX, 4UFD, 5EDM, 5E8E, 5EDK, 4UFE, 4UFG, 4UFF, 5A2M, 5JDU
מזהים
שמות נוספים	F2, PT, RPRGL2, THPH1, coagulation factor II, thrombin
מזהים חיצוניים	OMIM: 176930 MGI: 88380 HomoloGene: 426 GeneCards: F2
מיקום הגן (באדם) כרומוזום כרומוזום 11 עמדה 11p11.2 התחלה 46,719,196 bp סוף 46,739,506 bp
מיקום הגן (בעכבר) כרומוזום כרומוזום 2 (בעכבר) עמדה 2 E1|2 50.63 cM התחלה 91,455,665 bp סוף 91,466,759 bp
תבנית ביטוי RNA נתוני התבטאות נוספים
אונטולוגיית גנים (GO) תפקיד מולקולרי • calcium ion binding • היקשרות לקולטן • GO:0070122 פעילות פפטידאז • פעילות הידרוליזה • growth factor activity • serine-type peptidase activity • thrombospondin receptor activity • GO:0001948, GO:0016582 קשירת חלבונים • פעילות אנדופפטידאז מסוג סרין • lipopolysaccharide binding • heparin binding • GO:0010577 enzyme activator activity מיקום בתא • אקסוזום • blood microparticle • endoplasmic reticulum lumen • Golgi lumen • קרום התא • אזור חוץ תאי • חלל חוץ תאי • external side of plasma membrane • collagen-containing extracellular matrix תהליכים ביולוגיים • blood coagulation, intrinsic pathway • regulation of blood coagulation • positive regulation of phosphatidylinositol 3-kinase signaling • positive regulation of collagen biosynthetic process • multicellular organism development • peptidyl-glutamic acid carboxylation • acute-phase response • positive regulation of reactive oxygen species metabolic process • endoplasmic reticulum to Golgi vesicle-mediated transport • positive regulation of cell growth • cell surface receptor signaling pathway • בקרת גנים • positive regulation of release of sequestered calcium ion into cytosol • בקרה חיובית של שגשוג תאים • leukocyte migration • negative regulation of fibrinolysis • positive regulation of blood coagulation • regulation of cytosolic calcium ion concentration • response to wounding • signal peptide processing • positive regulation of phospholipase C-activating G protein-coupled receptor signaling pathway • regulation of cell shape • עצירת דימום • negative regulation of proteolysis • negative regulation of platelet activation • negative regulation of astrocyte differentiation • בקרה חיובית על זרחון חלבונים • פיברינוליטים • קרישת דם • פרוטאוליזה • platelet activation • positive regulation of protein localization to nucleus • positive regulation of lipid kinase activity • regulation of complement activation • antimicrobial humoral immune response mediated by antimicrobial peptide • negative regulation of cytokine production involved in inflammatory response • בקרה על פעילות קולטנים • G protein-coupled receptor signaling pathway • positive regulation of receptor signaling pathway via JAK-STAT • blood coagulation, fibrin clot formation מקורות: Amigo / QuickGO
אורתולוגים
מינים	אדם	עכבר
Entrez	2147	14061
Ensembl	ENSG00000180210	ENSMUSG00000027249
UniProt	P00734	P19221
RefSeq (mRNA)	NM_000506 NM_001311257	NM_010168
RefSeq (חלבון)	NP_000497	NP_034298
מיקום (UCSC)	Chr 11: 46.72 – 46.74 Mb	Chr 2: 91.46 – 91.47 Mb
חיפוש PubMed
ויקינתונים
צפייה/עריכה נתוני אדם צפייה/עריכה נתוני עכבר

קרישי הדם מורכבים מפיברין ונוצרים בזכות הפעילות האנזימטית של תרומבין, שהופך פיברינוגן מסיס במים לפיברין שאינו מסיס. תרומבין לא רק מקצץ פיברינוגן לפיברין אלא גם משפעל את פקטור 13 (factor XIII) אשר מחזק את קשרי הפיברין ומוביל ליצירת קריש דם קשיח ויציב.

התרומבין הוא תוצרת הגוף אולם אינו מצוי בדם בשגרה, אלא נוצר מפרותרומבין כאשר תאים נפגעים ומופעלת מערכת הקרישה. פרותרומבין נוצר בכבד בעזרת ויטמין K. הפיכת פרותרומבין לתרומבין תלויה בנוכחות יוני סידן והאנזים תרומבופלסטין.

מבנה

אנזים התרומבין התגלה על ידי החוקר האמריקאי סיגראס בשיטת הקריסטלוגרפיה. תרומבין הוא חלבון אשר מכיל כ-4% פחמימות ולכן יכול להיחשב גם כגליקופרוטאין. המולקולה מורכבת משתי שרשראות פוליפפטידיות עם קשר גופרי ביניהן. שרשרת A מורכבת מ-36 חומצות אמינו ושרשרת שנייה B מ-259. בשרשרת B נמצא האתר הפעיל של האנזים ורצף של חומצות אמינו הומולוגי למבנה של טריפסין וכימוטריפסין. תרומבין קיים בטבע בכמה צורות פעילות שנבדלות ביניהן במבנה שרשרת B. המסה המולרית שלו היא 36000 גרם/מול.

תפקיד

התפקיד העיקרי של תרומבין הוא בעצירת זרימת דם לאחר פציעה באמצעות השפעתו על פיברין, אולם הוא מעודד קרישה גם במסלולים נוספים וכן ידועים לו תפקידים שונים נוספים (בתהליכים דלקתיים, שגשוג תאים ועוד).

תפקידו המשמעותי ביותר הוא כאמור הפיכת פיברינוגן לפיברין, זאת באמצעות פירוק של ארבעה קשרי ארגיניל-גליצין במולקולת פיברינוגן. הידרוליזה זו מפרקת את הפיברינוגן לארבעה פפטידים. לאחר מכן נוצר פיברין מונומר, שבהמשך עובר פולימריזציה לגוש של פיברין הנמצא בטסית דם. בנוכחותו של התרומבין, מתרחשת הצטברות של טסיות דם והתקבצות של קריש דם.

ייחודיות התרומבין נובעת מכך שמשמש בו זמנית גם כמעודד קרישה (procoagulant) וגם כמדכא קרישה (anticoagulant). ההשפעה המהירה של תרומבין היא עידוד קרישה, מאוחר יותר במסלול ההשפעה האיטי תרומבין פועל כמדכא קרישה, על ידי כך שנקשר לקולטן על גבי ממברנת כלי הדם, תרומבומודולין. היקשרות תרומבין לתרומבומודולין מובילה לשרשרת תגובות המסתכמת בפירוק קרישי הפיברין והתמוססות קריש הדם.

מקור השם תרומבין

השם תרומבין מקורו מהמילה תרומבוס, מקורה מלטינית ומשמעותה קריש דם. מילה זו משמשת בסיס לשמות אחרים הנוגעים למערכת הקרישה - תרומבוזיס, תרומבוציטופניה, תרומבוציטוזיס, תרומבואמבולי ועוד.

קישורים חיצוניים

מדיה וקבצים בנושא תרומבין בוויקישיתוף