מחקרים גנטיים על יהודים – הבדלי גרסאות

בשנת 2004, החוקר שן ועמיתיו השוו את ה-Y-DNA וה-mtDNA של 12 גברים שומרונים לזה של 158 גברים שאינם שומרונים, כולל גברים יהודים משש עדות שונות ([[יהדות אתיופיה|אתיופים]], [[יהדות אשכנז|אשכנזים]], [[יהדות בבל|עיראקים]], [[יהדות צפון אפריקה|צפון אפריקאים]], [[יהדות לוב|טריפוליטאים]], [[יהדות מרוקו|מרוקאים]] ו[[יהדות תימן|תימנים]]) ו־2 אוכלוסיות לא יהודיות מישראל ([[דרוזים]] ו[[ערבים-ישראלים|ערבים]]). במחקר התגלה כי קיימים קווי דמיון משמעותיים בין שושלות אבהיות של יהודים ושומרונים, אך השושלות האימהיות שונות בין שתי האוכלוסיות. המרחקים הגנטיים בהשוואה בין זוגות (Fst) בין 11 אוכלוסיות מ-AMOVA הוחלו על הנתונים של כרומוזום Y ושל המיטוכונדריה. מבחינת כרומוזום Y, כל הקבוצות היהודיות (פרט ליהודי אתיופיה) קשורות זו לזו ואינן שונות באופן משמעותי מהשומרונים (0.041) או מהדרוזים (0.033), אך שונות מהערבים הפלסטינים (0.163), מהאפריקאים (0.219), ומהאירופים (0.111). מחקר זה הצביע על כך שלכרומוזום Y השומרוני והיהודי יש זיקה גדולה בהרבה זה לזה מאשר לשכניהם הגאוגרפיים, הערבים הפלסטינים. זה מצביע על כך שהשניים חולקים אוכלוסייה משותפת של המזרח הקרוב לפני ההתפצלות שלהם במאה הרביעית לפני הספירה, ותומך בנרטיב השומרוני של מוצא מבני ישראל ששרדו את גלות אשור ולא מאוכלוסיות זרות שהובאו לאזור על ידי האימפריה האשורית.{{הערה|שם=shen-2004}} עם זאת, תוצאות ה-mtDNA כלל לא תאמו אוכלוסיות יהודיות אחרות, מה שתומך במסורת היהודית (במקרא ובתלמוד) של עקירת אוכלוסיית ממלכת ישראל בידי ה[[אשור]]ים. מתוצאות אלו הסיקו החוקרים כי השומרונים הם צאצאים של גברים עבריים ונשים לא-עבריות, דבר המאשש מרכיבים של הנרטיבים היהודיים והשומרוניים כאחד.<ref>{{Cite web|date=9 December 2009|title=Good Genes: How Science Helped the Samaritans Find Their Roots|url=http://boingboing.net/2009/12/09/good-genes-how-scien.html|access-date=28 May 2017|website=Boing Boing}}</ref>