מעגל קרבס – הבדלי גרסאות
תוכן שנמחק תוכן שנוסף
←פתיח: מיותר |
הנדב הנכון (שיחה | תרומות) מאין תקציר עריכה |
||
שורה 24:
המעגל מורכב משרשרת של שמונה [[תגובה כימית|תגובות כימיות]]; בתגובה הראשונה משתתף חומר (המכיל 4 אטומי פחמן) הנקרא '''[[אוקסלואצטט]]''' (Oxaloacetate); חומר זה נוצר גם בתגובה האחרונה בשרשרת, ולפיכך מדובר ב"מעגל": אוקסלואצטט מגיב בתחילת המעגל עם [[אצטיל קואנזים A]], וגורם בכך להתנעת התהליך; [[מולקולה|מולקולת]] האוקסלואצטט הנוצרת בסוף התהליך יכולה להגיב עם עוד מולקולת אצטיל קואנזים A ולהתניע מעגל חדש; לפיכך, מולקולת אוקסלואצטט אחת יכולה להגיב עם מספר בלתי מוגבל של מולקולות אצטיל קואנזים A.
* אוקסאלואצטט מתחבר לאצטיל קואנזים A ויוצר [[חומצה ציטרית|ציטרט]] (Citrate), מולקולה בת שישה פחמנים. שלב זה מתרחש בעזרת האנזים citrate synthase. זהו שלב
▲* אוקסאלואצטט מתחבר לאצטיל קואנזים A ויוצר [[חומצה ציטרית|ציטרט]] (Citrate), מולקולה בת שישה פחמנים. שלב זה מתרחש בעזרת האנזים citrate synthase. שלב זה הינו חד כיווני.
* ציטרט עובר שינוי [[איזומר|איזומרי]] והופך לאיזוציטרט (Isocitrate). שלב זה מתרחש בעזרת האנזים aconitase.
* איזוציטרט מאבד [[פחמן דו-חמצני]] והופך לאלפא-קטוגלוטרט (α-Ketoglutarate), מולקולה בת חמישה פחמנים. שלב זה מתרחש בעזרת האנזים isocitrate dehydrogenase.
שורה 58 ⟵ 57:
|}
האנזים ציטראט סינתאז המצוי אצל [[בעלי חיים]], [[צמחים]], [[פטריות]], [[ארכיאה]] ו[[חיידקים גראם-חיוביים]] מורכב מ-2 דומיינים, קטן וגדול, וביניהם נמצא האתר הפעיל של האנזים, ובו 2 אתרי קשירה - האחד לציטראט או לאוקסלואצטט והשני לקואנזים A. האתר הפעיל מורכב מ-3 שיירי [[חומצות אמינו]] ("[[שלשה קטליטית]]") החיוניים לפעילותו - 2 שיירי [[היסטידין]] ושייר [[אספרטט]] אחד (His<sup>274</sup>, His<sup>320</sup> ו-Asp<sup>375</sup>), להם סלקטיביות גבוהה ל[[סובסטרט|סובסטרטים]] של הריאקציה. צורתו המרחבית של האנזים משתנה מפתוח לסגור בעת הקישור עם הסובסטרטים שלו (כמו אוקסלואצטט). אצל [[אצות]] ו[[חיידקים גראם-שליליים]], האנזים מורכב מ-4 עד 6 דומיינים זהים והוא תלוי [[NADH]]. ציטראט סינתאז
ההידרוליזה של הקשר התיאו-אסטרי עתיר האנרגיה הופכת את הריאקציה לאקסרגונית מאוד. [[אנרגיה חופשית של גיבס|האנרגיה החופשית הסטנדרטית של גיבס]] בריאקציה זו היא שלילית מאוד, ומשמעות הדבר ששלב זה
מולקולת הקואנזים A ששוחררה בריאקציה ממוחזרת, ותשתתף בדה-קרבוקסילציה חמצונית של מולקולת פירובט נוספת שתיכנס לקומפלקס PDH.{{הערה|שם=נלסון, עמ' 608-9}}
|